Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CopaQ8CIE6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CopaQ8CIE6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CopaQ8CIE6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CopaQ8CIE6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CopaQ8CIE6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CopaQ8CIE6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CopaQ8CIE6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CopaQ8CIE6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CopaQ8CIE6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CopaQ8CIE6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CopaQ8CIE6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CopaQ8CIE6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CopaQ8CIE6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CopaQ8CIE6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CopaQ8CIE6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CopaQ8CIE6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CopaQ8CIE6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CopaQ8CIE6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CopaQ8CIE6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CopaQ8CIE6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CopaQ8CIE6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CopaQ8CIE6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CopaQ8CIE6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CopaQ8CIE6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CopaQ8CIE6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CopaQ8CIE6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CopaQ8CIE6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CopaQ8CIE6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CopaQ8CIE6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CopaQ8CIE6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CopaQ8CIE6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CopaQ8CIE6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CopaQ8CIE6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CopaQ8CIE6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CopaQ8CIE6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CopaQ8CIE6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CopaQ8CIE6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CopaQ8CIE6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CopaQ8CIE6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CopaQ8CIE6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CopaQ8CIE6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CopaQ8CIE6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CopaQ8CIE6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CopaQ8CIE6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CopaQ8CIE6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CopaQ8CIE6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CopaQ8CIE6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CopaQ8CIE6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CopaQ8CIE6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CopaQ8CIE6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CopaQ8CIE6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CopaQ8CIE6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CopaQ8CIE6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CopaQ8CIE6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CopaQ8CIE6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CopaQ8CIE6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CopaQ8CIE6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CopaQ8CIE6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CopaQ8CIE6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CopaQ8CIE6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CopaQ8CIE6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CopaQ8CIE6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CopaQ8CIE6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CopaQ8CIE6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CopaQ8CIE6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CopaQ8CIE6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CopaQ8CIE6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CopaQ8CIE6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CopaQ8CIE6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CopaQ8CIE6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CopaQ8CIE6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CopaQ8CIE6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CopaQ8CIE6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CopaQ8CIE6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CopaQ8CIE6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CopaQ8CIE6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CopaQ8CIE6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CopaQ8CIE6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CopaQ8CIE6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CopaQ8CIE6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CopaQ8CIE6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CopaQ8CIE6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CopaQ8CIE6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CopaQ8CIE6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CopaQ8CIE6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CopaQ8CIE6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CopaQ8CIE6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CopaQ8CIE6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CopaQ8CIE6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CopaQ8CIE6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CopaQ8CIE6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CopaQ8CIE6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CopaQ8CIE6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CopaQ8CIE6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CopaQ8CIE6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CopaQ8CIE6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CopaQ8CIE6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CopaQ8CIE6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CopaQ8CIE6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms