Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCM6

Timm21, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim21, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm21Q8CCM6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Timm21Q8CCM6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Timm21Q8CCM6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Timm21Q8CCM6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Timm21Q8CCM6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Timm21Q8CCM6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Timm21Q8CCM6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Timm21Q8CCM6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Timm21Q8CCM6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Timm21Q8CCM6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Timm21Q8CCM6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Timm21Q8CCM6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Timm21Q8CCM6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Timm21Q8CCM6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Timm21Q8CCM6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Timm21Q8CCM6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Timm21Q8CCM6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Timm21Q8CCM6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Timm21Q8CCM6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Timm21Q8CCM6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Timm21Q8CCM6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Timm21Q8CCM6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Timm21Q8CCM6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Timm21Q8CCM6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Timm21Q8CCM6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Timm21Q8CCM6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Timm21Q8CCM6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Timm21Q8CCM6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Timm21Q8CCM6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Timm21Q8CCM6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Timm21Q8CCM6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Timm21Q8CCM6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Timm21Q8CCM6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Timm21Q8CCM6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Timm21Q8CCM6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Timm21Q8CCM6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Timm21Q8CCM6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Timm21Q8CCM6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Timm21Q8CCM6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Timm21Q8CCM6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Timm21Q8CCM6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Timm21Q8CCM6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Timm21Q8CCM6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Timm21Q8CCM6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Timm21Q8CCM6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Timm21Q8CCM6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Timm21Q8CCM6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Timm21Q8CCM6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Timm21Q8CCM6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Timm21Q8CCM6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Timm21Q8CCM6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Timm21Q8CCM6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Timm21Q8CCM6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Timm21Q8CCM6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Timm21Q8CCM6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Timm21Q8CCM6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Timm21Q8CCM6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Timm21Q8CCM6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Timm21Q8CCM6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Timm21Q8CCM6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Timm21Q8CCM6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Timm21Q8CCM6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Timm21Q8CCM6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Timm21Q8CCM6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Timm21Q8CCM6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Timm21Q8CCM6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Timm21Q8CCM6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Timm21Q8CCM6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Timm21Q8CCM6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Timm21Q8CCM6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Timm21Q8CCM6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Timm21Q8CCM6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Timm21Q8CCM6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Timm21Q8CCM6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Timm21Q8CCM6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Timm21Q8CCM6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Timm21Q8CCM6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Timm21Q8CCM6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Timm21Q8CCM6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Timm21Q8CCM6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Timm21Q8CCM6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Timm21Q8CCM6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Timm21Q8CCM6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Timm21Q8CCM6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Timm21Q8CCM6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Timm21Q8CCM6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Timm21Q8CCM6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Timm21Q8CCM6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Timm21Q8CCM6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Timm21Q8CCM6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Timm21Q8CCM6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Timm21Q8CCM6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Timm21Q8CCM6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Timm21Q8CCM6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Timm21Q8CCM6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Timm21Q8CCM6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Timm21Q8CCM6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Timm21Q8CCM6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Timm21Q8CCM6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Timm21Q8CCM6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms