Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBM3

Gm16223, MCG145574 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16223Q8CBM3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm16223Q8CBM3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm16223Q8CBM3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm16223Q8CBM3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm16223Q8CBM3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm16223Q8CBM3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm16223Q8CBM3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm16223Q8CBM3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm16223Q8CBM3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm16223Q8CBM3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm16223Q8CBM3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm16223Q8CBM3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm16223Q8CBM3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm16223Q8CBM3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm16223Q8CBM3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm16223Q8CBM3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm16223Q8CBM3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm16223Q8CBM3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm16223Q8CBM3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm16223Q8CBM3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm16223Q8CBM3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm16223Q8CBM3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm16223Q8CBM3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm16223Q8CBM3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm16223Q8CBM3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm16223Q8CBM3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm16223Q8CBM3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm16223Q8CBM3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm16223Q8CBM3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm16223Q8CBM3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm16223Q8CBM3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm16223Q8CBM3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm16223Q8CBM3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm16223Q8CBM3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm16223Q8CBM3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm16223Q8CBM3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm16223Q8CBM3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm16223Q8CBM3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm16223Q8CBM3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm16223Q8CBM3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm16223Q8CBM3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm16223Q8CBM3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm16223Q8CBM3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm16223Q8CBM3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm16223Q8CBM3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm16223Q8CBM3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm16223Q8CBM3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm16223Q8CBM3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm16223Q8CBM3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm16223Q8CBM3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm16223Q8CBM3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm16223Q8CBM3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm16223Q8CBM3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm16223Q8CBM3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm16223Q8CBM3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm16223Q8CBM3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm16223Q8CBM3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm16223Q8CBM3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm16223Q8CBM3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm16223Q8CBM3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm16223Q8CBM3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm16223Q8CBM3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm16223Q8CBM3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm16223Q8CBM3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm16223Q8CBM3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm16223Q8CBM3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm16223Q8CBM3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm16223Q8CBM3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm16223Q8CBM3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm16223Q8CBM3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm16223Q8CBM3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm16223Q8CBM3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm16223Q8CBM3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm16223Q8CBM3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm16223Q8CBM3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm16223Q8CBM3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm16223Q8CBM3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm16223Q8CBM3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm16223Q8CBM3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm16223Q8CBM3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm16223Q8CBM3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm16223Q8CBM3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm16223Q8CBM3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm16223Q8CBM3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm16223Q8CBM3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm16223Q8CBM3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm16223Q8CBM3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm16223Q8CBM3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm16223Q8CBM3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm16223Q8CBM3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm16223Q8CBM3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm16223Q8CBM3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms