Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7M3

Trim9, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM9, mousemouse

Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim9Q8C7M3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim9Q8C7M3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim9Q8C7M3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim9Q8C7M3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim9Q8C7M3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim9Q8C7M3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim9Q8C7M3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim9Q8C7M3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim9Q8C7M3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim9Q8C7M3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim9Q8C7M3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Trim9Q8C7M3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim9Q8C7M3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim9Q8C7M3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim9Q8C7M3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim9Q8C7M3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim9Q8C7M3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim9Q8C7M3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim9Q8C7M3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim9Q8C7M3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim9Q8C7M3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim9Q8C7M3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim9Q8C7M3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim9Q8C7M3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim9Q8C7M3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim9Q8C7M3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim9Q8C7M3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim9Q8C7M3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim9Q8C7M3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim9Q8C7M3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim9Q8C7M3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim9Q8C7M3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim9Q8C7M3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim9Q8C7M3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim9Q8C7M3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim9Q8C7M3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim9Q8C7M3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim9Q8C7M3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim9Q8C7M3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim9Q8C7M3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim9Q8C7M3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim9Q8C7M3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim9Q8C7M3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim9Q8C7M3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim9Q8C7M3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim9Q8C7M3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim9Q8C7M3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim9Q8C7M3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim9Q8C7M3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim9Q8C7M3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Trim9Q8C7M3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim9Q8C7M3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim9Q8C7M3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim9Q8C7M3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim9Q8C7M3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim9Q8C7M3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim9Q8C7M3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim9Q8C7M3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim9Q8C7M3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim9Q8C7M3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim9Q8C7M3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim9Q8C7M3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim9Q8C7M3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim9Q8C7M3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim9Q8C7M3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim9Q8C7M3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim9Q8C7M3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim9Q8C7M3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim9Q8C7M3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim9Q8C7M3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim9Q8C7M3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim9Q8C7M3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim9Q8C7M3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim9Q8C7M3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim9Q8C7M3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim9Q8C7M3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim9Q8C7M3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim9Q8C7M3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim9Q8C7M3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim9Q8C7M3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim9Q8C7M3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim9Q8C7M3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim9Q8C7M3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim9Q8C7M3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim9Q8C7M3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim9Q8C7M3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim9Q8C7M3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim9Q8C7M3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim9Q8C7M3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim9Q8C7M3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim9Q8C7M3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim9Q8C7M3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim9Q8C7M3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim9Q8C7M3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim9Q8C7M3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim9Q8C7M3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim9Q8C7M3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim9Q8C7M3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim9Q8C7M3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim9Q8C7M3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms