Protein–RNA interactions for Protein: Q8C735

Lin9, Protein lin-9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin9Q8C735 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lin9Q8C735 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lin9Q8C735 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lin9Q8C735 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lin9Q8C735 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lin9Q8C735 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lin9Q8C735 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lin9Q8C735 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lin9Q8C735 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lin9Q8C735 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lin9Q8C735 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lin9Q8C735 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lin9Q8C735 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lin9Q8C735 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lin9Q8C735 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lin9Q8C735 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lin9Q8C735 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lin9Q8C735 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lin9Q8C735 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Lin9Q8C735 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lin9Q8C735 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lin9Q8C735 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lin9Q8C735 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lin9Q8C735 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lin9Q8C735 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Lin9Q8C735 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lin9Q8C735 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lin9Q8C735 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Lin9Q8C735 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lin9Q8C735 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lin9Q8C735 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lin9Q8C735 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lin9Q8C735 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lin9Q8C735 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lin9Q8C735 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lin9Q8C735 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lin9Q8C735 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lin9Q8C735 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lin9Q8C735 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lin9Q8C735 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lin9Q8C735 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lin9Q8C735 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lin9Q8C735 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lin9Q8C735 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lin9Q8C735 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lin9Q8C735 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lin9Q8C735 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lin9Q8C735 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lin9Q8C735 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Lin9Q8C735 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lin9Q8C735 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lin9Q8C735 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lin9Q8C735 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lin9Q8C735 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Lin9Q8C735 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lin9Q8C735 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lin9Q8C735 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lin9Q8C735 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lin9Q8C735 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lin9Q8C735 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lin9Q8C735 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lin9Q8C735 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lin9Q8C735 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lin9Q8C735 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lin9Q8C735 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lin9Q8C735 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lin9Q8C735 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lin9Q8C735 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lin9Q8C735 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lin9Q8C735 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lin9Q8C735 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lin9Q8C735 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lin9Q8C735 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lin9Q8C735 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lin9Q8C735 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lin9Q8C735 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lin9Q8C735 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lin9Q8C735 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lin9Q8C735 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lin9Q8C735 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lin9Q8C735 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lin9Q8C735 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lin9Q8C735 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lin9Q8C735 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Lin9Q8C735 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lin9Q8C735 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lin9Q8C735 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lin9Q8C735 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lin9Q8C735 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lin9Q8C735 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lin9Q8C735 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lin9Q8C735 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lin9Q8C735 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lin9Q8C735 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lin9Q8C735 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lin9Q8C735 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lin9Q8C735 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lin9Q8C735 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lin9Q8C735 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lin9Q8C735 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms