Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

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Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
4933409G03RikQ8C5U0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4933409G03RikQ8C5U0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4933409G03RikQ8C5U0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
4933409G03RikQ8C5U0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
4933409G03RikQ8C5U0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
4933409G03RikQ8C5U0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4933409G03RikQ8C5U0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4933409G03RikQ8C5U0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
4933409G03RikQ8C5U0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
4933409G03RikQ8C5U0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
4933409G03RikQ8C5U0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4933409G03RikQ8C5U0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
4933409G03RikQ8C5U0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4933409G03RikQ8C5U0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4933409G03RikQ8C5U0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
4933409G03RikQ8C5U0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4933409G03RikQ8C5U0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4933409G03RikQ8C5U0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
4933409G03RikQ8C5U0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
4933409G03RikQ8C5U0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4933409G03RikQ8C5U0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
4933409G03RikQ8C5U0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
4933409G03RikQ8C5U0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4933409G03RikQ8C5U0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4933409G03RikQ8C5U0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
4933409G03RikQ8C5U0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4933409G03RikQ8C5U0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4933409G03RikQ8C5U0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4933409G03RikQ8C5U0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
4933409G03RikQ8C5U0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
4933409G03RikQ8C5U0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4933409G03RikQ8C5U0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4933409G03RikQ8C5U0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
4933409G03RikQ8C5U0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4933409G03RikQ8C5U0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
4933409G03RikQ8C5U0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
4933409G03RikQ8C5U0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4933409G03RikQ8C5U0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4933409G03RikQ8C5U0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
4933409G03RikQ8C5U0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
4933409G03RikQ8C5U0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
4933409G03RikQ8C5U0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
4933409G03RikQ8C5U0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
4933409G03RikQ8C5U0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
4933409G03RikQ8C5U0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
4933409G03RikQ8C5U0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4933409G03RikQ8C5U0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
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4933409G03RikQ8C5U0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
4933409G03RikQ8C5U0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
4933409G03RikQ8C5U0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4933409G03RikQ8C5U0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
4933409G03RikQ8C5U0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4933409G03RikQ8C5U0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4933409G03RikQ8C5U0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4933409G03RikQ8C5U0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4933409G03RikQ8C5U0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4933409G03RikQ8C5U0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4933409G03RikQ8C5U0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4933409G03RikQ8C5U0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
4933409G03RikQ8C5U0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4933409G03RikQ8C5U0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4933409G03RikQ8C5U0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4933409G03RikQ8C5U0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4933409G03RikQ8C5U0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4933409G03RikQ8C5U0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4933409G03RikQ8C5U0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4933409G03RikQ8C5U0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4933409G03RikQ8C5U0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
4933409G03RikQ8C5U0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
4933409G03RikQ8C5U0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4933409G03RikQ8C5U0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4933409G03RikQ8C5U0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
4933409G03RikQ8C5U0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4933409G03RikQ8C5U0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4933409G03RikQ8C5U0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4933409G03RikQ8C5U0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4933409G03RikQ8C5U0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4933409G03RikQ8C5U0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4933409G03RikQ8C5U0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4933409G03RikQ8C5U0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4933409G03RikQ8C5U0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4933409G03RikQ8C5U0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
4933409G03RikQ8C5U0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
4933409G03RikQ8C5U0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
4933409G03RikQ8C5U0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4933409G03RikQ8C5U0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4933409G03RikQ8C5U0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4933409G03RikQ8C5U0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4933409G03RikQ8C5U0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4933409G03RikQ8C5U0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4933409G03RikQ8C5U0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4933409G03RikQ8C5U0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
4933409G03RikQ8C5U0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
4933409G03RikQ8C5U0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
4933409G03RikQ8C5U0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4933409G03RikQ8C5U0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
4933409G03RikQ8C5U0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
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