Protein–RNA interactions for Protein: Q8C561

Lmbrd2, LMBR1 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd2Q8C561 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lmbrd2Q8C561 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lmbrd2Q8C561 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lmbrd2Q8C561 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lmbrd2Q8C561 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lmbrd2Q8C561 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lmbrd2Q8C561 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lmbrd2Q8C561 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Lmbrd2Q8C561 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lmbrd2Q8C561 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lmbrd2Q8C561 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lmbrd2Q8C561 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lmbrd2Q8C561 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lmbrd2Q8C561 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Lmbrd2Q8C561 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lmbrd2Q8C561 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lmbrd2Q8C561 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lmbrd2Q8C561 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lmbrd2Q8C561 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lmbrd2Q8C561 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lmbrd2Q8C561 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lmbrd2Q8C561 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lmbrd2Q8C561 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lmbrd2Q8C561 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lmbrd2Q8C561 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lmbrd2Q8C561 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Lmbrd2Q8C561 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Lmbrd2Q8C561 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lmbrd2Q8C561 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lmbrd2Q8C561 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lmbrd2Q8C561 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lmbrd2Q8C561 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lmbrd2Q8C561 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lmbrd2Q8C561 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lmbrd2Q8C561 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Lmbrd2Q8C561 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lmbrd2Q8C561 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lmbrd2Q8C561 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lmbrd2Q8C561 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lmbrd2Q8C561 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lmbrd2Q8C561 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lmbrd2Q8C561 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lmbrd2Q8C561 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lmbrd2Q8C561 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lmbrd2Q8C561 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lmbrd2Q8C561 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lmbrd2Q8C561 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lmbrd2Q8C561 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lmbrd2Q8C561 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lmbrd2Q8C561 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lmbrd2Q8C561 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lmbrd2Q8C561 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lmbrd2Q8C561 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lmbrd2Q8C561 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lmbrd2Q8C561 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lmbrd2Q8C561 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lmbrd2Q8C561 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lmbrd2Q8C561 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Lmbrd2Q8C561 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lmbrd2Q8C561 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lmbrd2Q8C561 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lmbrd2Q8C561 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lmbrd2Q8C561 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lmbrd2Q8C561 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Lmbrd2Q8C561 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lmbrd2Q8C561 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lmbrd2Q8C561 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lmbrd2Q8C561 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lmbrd2Q8C561 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lmbrd2Q8C561 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lmbrd2Q8C561 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lmbrd2Q8C561 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lmbrd2Q8C561 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lmbrd2Q8C561 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lmbrd2Q8C561 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lmbrd2Q8C561 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lmbrd2Q8C561 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lmbrd2Q8C561 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lmbrd2Q8C561 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Lmbrd2Q8C561 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lmbrd2Q8C561 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lmbrd2Q8C561 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lmbrd2Q8C561 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lmbrd2Q8C561 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lmbrd2Q8C561 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Lmbrd2Q8C561 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Lmbrd2Q8C561 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lmbrd2Q8C561 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lmbrd2Q8C561 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lmbrd2Q8C561 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lmbrd2Q8C561 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Lmbrd2Q8C561 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmbrd2Q8C561 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmbrd2Q8C561 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmbrd2Q8C561 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmbrd2Q8C561 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmbrd2Q8C561 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmbrd2Q8C561 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmbrd2Q8C561 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmbrd2Q8C561 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
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