Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1F4

Csgalnact2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csgalnact2Q8C1F4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Csgalnact2Q8C1F4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Csgalnact2Q8C1F4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Csgalnact2Q8C1F4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Csgalnact2Q8C1F4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Csgalnact2Q8C1F4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Csgalnact2Q8C1F4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Csgalnact2Q8C1F4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Csgalnact2Q8C1F4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Csgalnact2Q8C1F4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Csgalnact2Q8C1F4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Csgalnact2Q8C1F4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Csgalnact2Q8C1F4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Csgalnact2Q8C1F4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Csgalnact2Q8C1F4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Csgalnact2Q8C1F4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Csgalnact2Q8C1F4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Csgalnact2Q8C1F4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Csgalnact2Q8C1F4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Csgalnact2Q8C1F4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Csgalnact2Q8C1F4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Csgalnact2Q8C1F4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Csgalnact2Q8C1F4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Csgalnact2Q8C1F4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Csgalnact2Q8C1F4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Csgalnact2Q8C1F4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Csgalnact2Q8C1F4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Csgalnact2Q8C1F4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Csgalnact2Q8C1F4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Csgalnact2Q8C1F4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Csgalnact2Q8C1F4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Csgalnact2Q8C1F4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Csgalnact2Q8C1F4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Csgalnact2Q8C1F4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Csgalnact2Q8C1F4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Csgalnact2Q8C1F4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Csgalnact2Q8C1F4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Csgalnact2Q8C1F4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Csgalnact2Q8C1F4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Csgalnact2Q8C1F4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Csgalnact2Q8C1F4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Csgalnact2Q8C1F4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Csgalnact2Q8C1F4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Csgalnact2Q8C1F4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Csgalnact2Q8C1F4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Csgalnact2Q8C1F4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Csgalnact2Q8C1F4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Csgalnact2Q8C1F4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Csgalnact2Q8C1F4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Csgalnact2Q8C1F4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Csgalnact2Q8C1F4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Csgalnact2Q8C1F4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Csgalnact2Q8C1F4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Csgalnact2Q8C1F4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Csgalnact2Q8C1F4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Csgalnact2Q8C1F4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Csgalnact2Q8C1F4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Csgalnact2Q8C1F4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Csgalnact2Q8C1F4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Csgalnact2Q8C1F4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Csgalnact2Q8C1F4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Csgalnact2Q8C1F4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Csgalnact2Q8C1F4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Csgalnact2Q8C1F4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Csgalnact2Q8C1F4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Csgalnact2Q8C1F4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Csgalnact2Q8C1F4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Csgalnact2Q8C1F4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Csgalnact2Q8C1F4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Csgalnact2Q8C1F4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Csgalnact2Q8C1F4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Csgalnact2Q8C1F4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Csgalnact2Q8C1F4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Csgalnact2Q8C1F4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Csgalnact2Q8C1F4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Csgalnact2Q8C1F4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Csgalnact2Q8C1F4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Csgalnact2Q8C1F4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Csgalnact2Q8C1F4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Csgalnact2Q8C1F4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Csgalnact2Q8C1F4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Csgalnact2Q8C1F4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Csgalnact2Q8C1F4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Csgalnact2Q8C1F4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Csgalnact2Q8C1F4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Csgalnact2Q8C1F4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Csgalnact2Q8C1F4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Csgalnact2Q8C1F4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Csgalnact2Q8C1F4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Csgalnact2Q8C1F4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Csgalnact2Q8C1F4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Csgalnact2Q8C1F4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Csgalnact2Q8C1F4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Csgalnact2Q8C1F4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Csgalnact2Q8C1F4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Csgalnact2Q8C1F4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Csgalnact2Q8C1F4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Csgalnact2Q8C1F4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Csgalnact2Q8C1F4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Csgalnact2Q8C1F4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms