Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1B2

Tiparp, TCDD-inducible poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TiparpQ8C1B2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TiparpQ8C1B2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TiparpQ8C1B2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TiparpQ8C1B2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TiparpQ8C1B2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TiparpQ8C1B2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TiparpQ8C1B2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TiparpQ8C1B2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TiparpQ8C1B2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TiparpQ8C1B2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TiparpQ8C1B2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TiparpQ8C1B2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TiparpQ8C1B2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TiparpQ8C1B2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TiparpQ8C1B2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TiparpQ8C1B2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TiparpQ8C1B2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TiparpQ8C1B2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TiparpQ8C1B2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TiparpQ8C1B2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TiparpQ8C1B2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TiparpQ8C1B2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TiparpQ8C1B2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TiparpQ8C1B2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TiparpQ8C1B2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TiparpQ8C1B2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TiparpQ8C1B2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TiparpQ8C1B2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TiparpQ8C1B2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TiparpQ8C1B2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TiparpQ8C1B2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TiparpQ8C1B2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TiparpQ8C1B2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TiparpQ8C1B2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TiparpQ8C1B2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TiparpQ8C1B2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TiparpQ8C1B2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TiparpQ8C1B2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TiparpQ8C1B2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TiparpQ8C1B2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TiparpQ8C1B2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TiparpQ8C1B2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TiparpQ8C1B2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TiparpQ8C1B2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TiparpQ8C1B2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TiparpQ8C1B2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TiparpQ8C1B2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TiparpQ8C1B2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TiparpQ8C1B2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TiparpQ8C1B2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TiparpQ8C1B2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TiparpQ8C1B2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TiparpQ8C1B2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TiparpQ8C1B2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TiparpQ8C1B2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TiparpQ8C1B2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TiparpQ8C1B2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TiparpQ8C1B2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TiparpQ8C1B2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TiparpQ8C1B2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TiparpQ8C1B2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TiparpQ8C1B2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TiparpQ8C1B2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TiparpQ8C1B2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TiparpQ8C1B2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TiparpQ8C1B2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TiparpQ8C1B2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TiparpQ8C1B2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TiparpQ8C1B2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TiparpQ8C1B2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TiparpQ8C1B2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TiparpQ8C1B2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TiparpQ8C1B2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TiparpQ8C1B2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TiparpQ8C1B2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TiparpQ8C1B2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TiparpQ8C1B2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TiparpQ8C1B2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TiparpQ8C1B2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TiparpQ8C1B2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TiparpQ8C1B2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TiparpQ8C1B2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TiparpQ8C1B2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TiparpQ8C1B2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TiparpQ8C1B2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TiparpQ8C1B2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TiparpQ8C1B2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TiparpQ8C1B2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TiparpQ8C1B2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TiparpQ8C1B2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TiparpQ8C1B2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TiparpQ8C1B2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TiparpQ8C1B2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TiparpQ8C1B2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TiparpQ8C1B2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TiparpQ8C1B2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TiparpQ8C1B2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TiparpQ8C1B2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TiparpQ8C1B2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TiparpQ8C1B2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.9 ms