Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0L9

Gpcpd1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpcpd1Q8C0L9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gpcpd1Q8C0L9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gpcpd1Q8C0L9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gpcpd1Q8C0L9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gpcpd1Q8C0L9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gpcpd1Q8C0L9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gpcpd1Q8C0L9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gpcpd1Q8C0L9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gpcpd1Q8C0L9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gpcpd1Q8C0L9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gpcpd1Q8C0L9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Gpcpd1Q8C0L9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gpcpd1Q8C0L9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gpcpd1Q8C0L9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gpcpd1Q8C0L9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gpcpd1Q8C0L9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gpcpd1Q8C0L9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gpcpd1Q8C0L9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gpcpd1Q8C0L9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gpcpd1Q8C0L9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gpcpd1Q8C0L9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gpcpd1Q8C0L9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gpcpd1Q8C0L9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gpcpd1Q8C0L9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gpcpd1Q8C0L9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gpcpd1Q8C0L9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Gpcpd1Q8C0L9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gpcpd1Q8C0L9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gpcpd1Q8C0L9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gpcpd1Q8C0L9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gpcpd1Q8C0L9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Gpcpd1Q8C0L9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gpcpd1Q8C0L9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gpcpd1Q8C0L9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gpcpd1Q8C0L9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gpcpd1Q8C0L9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gpcpd1Q8C0L9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gpcpd1Q8C0L9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gpcpd1Q8C0L9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gpcpd1Q8C0L9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gpcpd1Q8C0L9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gpcpd1Q8C0L9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gpcpd1Q8C0L9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gpcpd1Q8C0L9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gpcpd1Q8C0L9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gpcpd1Q8C0L9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gpcpd1Q8C0L9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Gpcpd1Q8C0L9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gpcpd1Q8C0L9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gpcpd1Q8C0L9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gpcpd1Q8C0L9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gpcpd1Q8C0L9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gpcpd1Q8C0L9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gpcpd1Q8C0L9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gpcpd1Q8C0L9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gpcpd1Q8C0L9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gpcpd1Q8C0L9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gpcpd1Q8C0L9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gpcpd1Q8C0L9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gpcpd1Q8C0L9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gpcpd1Q8C0L9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gpcpd1Q8C0L9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gpcpd1Q8C0L9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gpcpd1Q8C0L9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Gpcpd1Q8C0L9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gpcpd1Q8C0L9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Gpcpd1Q8C0L9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gpcpd1Q8C0L9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gpcpd1Q8C0L9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gpcpd1Q8C0L9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gpcpd1Q8C0L9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Gpcpd1Q8C0L9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gpcpd1Q8C0L9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gpcpd1Q8C0L9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gpcpd1Q8C0L9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gpcpd1Q8C0L9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gpcpd1Q8C0L9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gpcpd1Q8C0L9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gpcpd1Q8C0L9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Gpcpd1Q8C0L9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gpcpd1Q8C0L9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gpcpd1Q8C0L9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gpcpd1Q8C0L9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gpcpd1Q8C0L9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gpcpd1Q8C0L9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gpcpd1Q8C0L9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gpcpd1Q8C0L9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gpcpd1Q8C0L9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gpcpd1Q8C0L9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gpcpd1Q8C0L9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gpcpd1Q8C0L9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gpcpd1Q8C0L9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gpcpd1Q8C0L9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gpcpd1Q8C0L9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gpcpd1Q8C0L9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gpcpd1Q8C0L9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gpcpd1Q8C0L9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gpcpd1Q8C0L9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gpcpd1Q8C0L9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gpcpd1Q8C0L9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms