Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0E3

Trim47, Tripartite motif-containing protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim47Q8C0E3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim47Q8C0E3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim47Q8C0E3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim47Q8C0E3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim47Q8C0E3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim47Q8C0E3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim47Q8C0E3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim47Q8C0E3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim47Q8C0E3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim47Q8C0E3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim47Q8C0E3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim47Q8C0E3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim47Q8C0E3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim47Q8C0E3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim47Q8C0E3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim47Q8C0E3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim47Q8C0E3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim47Q8C0E3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim47Q8C0E3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim47Q8C0E3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trim47Q8C0E3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim47Q8C0E3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim47Q8C0E3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim47Q8C0E3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim47Q8C0E3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim47Q8C0E3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim47Q8C0E3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim47Q8C0E3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim47Q8C0E3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim47Q8C0E3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim47Q8C0E3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim47Q8C0E3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim47Q8C0E3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim47Q8C0E3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim47Q8C0E3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim47Q8C0E3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim47Q8C0E3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim47Q8C0E3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim47Q8C0E3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim47Q8C0E3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim47Q8C0E3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim47Q8C0E3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim47Q8C0E3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim47Q8C0E3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim47Q8C0E3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim47Q8C0E3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim47Q8C0E3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim47Q8C0E3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim47Q8C0E3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim47Q8C0E3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim47Q8C0E3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim47Q8C0E3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim47Q8C0E3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim47Q8C0E3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim47Q8C0E3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim47Q8C0E3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim47Q8C0E3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim47Q8C0E3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim47Q8C0E3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim47Q8C0E3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim47Q8C0E3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim47Q8C0E3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim47Q8C0E3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim47Q8C0E3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim47Q8C0E3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim47Q8C0E3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim47Q8C0E3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim47Q8C0E3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim47Q8C0E3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim47Q8C0E3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim47Q8C0E3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim47Q8C0E3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim47Q8C0E3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim47Q8C0E3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim47Q8C0E3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim47Q8C0E3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim47Q8C0E3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim47Q8C0E3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim47Q8C0E3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim47Q8C0E3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim47Q8C0E3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim47Q8C0E3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim47Q8C0E3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim47Q8C0E3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim47Q8C0E3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim47Q8C0E3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim47Q8C0E3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim47Q8C0E3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim47Q8C0E3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim47Q8C0E3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim47Q8C0E3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim47Q8C0E3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim47Q8C0E3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim47Q8C0E3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim47Q8C0E3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim47Q8C0E3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim47Q8C0E3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim47Q8C0E3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim47Q8C0E3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim47Q8C0E3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms