Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfsfm13Q8BXS2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfsfm13Q8BXS2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfsfm13Q8BXS2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfsfm13Q8BXS2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfsfm13Q8BXS2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfsfm13Q8BXS2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfsfm13Q8BXS2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfsfm13Q8BXS2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfsfm13Q8BXS2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfsfm13Q8BXS2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfsfm13Q8BXS2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfsfm13Q8BXS2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfsfm13Q8BXS2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfsfm13Q8BXS2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfsfm13Q8BXS2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfsfm13Q8BXS2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfsfm13Q8BXS2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfsfm13Q8BXS2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tnfsfm13Q8BXS2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfsfm13Q8BXS2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfsfm13Q8BXS2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfsfm13Q8BXS2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfsfm13Q8BXS2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfsfm13Q8BXS2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfsfm13Q8BXS2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfsfm13Q8BXS2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfsfm13Q8BXS2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfsfm13Q8BXS2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfsfm13Q8BXS2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfsfm13Q8BXS2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfsfm13Q8BXS2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfsfm13Q8BXS2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfsfm13Q8BXS2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfsfm13Q8BXS2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfsfm13Q8BXS2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfsfm13Q8BXS2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfsfm13Q8BXS2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsfm13Q8BXS2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsfm13Q8BXS2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsfm13Q8BXS2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsfm13Q8BXS2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsfm13Q8BXS2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsfm13Q8BXS2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsfm13Q8BXS2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsfm13Q8BXS2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsfm13Q8BXS2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsfm13Q8BXS2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsfm13Q8BXS2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsfm13Q8BXS2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsfm13Q8BXS2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsfm13Q8BXS2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsfm13Q8BXS2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsfm13Q8BXS2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsfm13Q8BXS2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfsfm13Q8BXS2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfsfm13Q8BXS2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfsfm13Q8BXS2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfsfm13Q8BXS2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfsfm13Q8BXS2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfsfm13Q8BXS2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfsfm13Q8BXS2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfsfm13Q8BXS2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfsfm13Q8BXS2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfsfm13Q8BXS2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfsfm13Q8BXS2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfsfm13Q8BXS2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfsfm13Q8BXS2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfsfm13Q8BXS2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfsfm13Q8BXS2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfsfm13Q8BXS2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfsfm13Q8BXS2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfsfm13Q8BXS2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfsfm13Q8BXS2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfsfm13Q8BXS2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfsfm13Q8BXS2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfsfm13Q8BXS2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfsfm13Q8BXS2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfsfm13Q8BXS2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfsfm13Q8BXS2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfsfm13Q8BXS2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfsfm13Q8BXS2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfsfm13Q8BXS2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms