Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX46

Skor1, SKI family transcriptional corepressor 1, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skor1Q8BX46 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Skor1Q8BX46 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Skor1Q8BX46 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Skor1Q8BX46 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Skor1Q8BX46 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Skor1Q8BX46 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Skor1Q8BX46 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Skor1Q8BX46 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Skor1Q8BX46 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Skor1Q8BX46 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Skor1Q8BX46 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Skor1Q8BX46 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Skor1Q8BX46 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Skor1Q8BX46 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Skor1Q8BX46 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Skor1Q8BX46 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Skor1Q8BX46 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Skor1Q8BX46 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Skor1Q8BX46 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Skor1Q8BX46 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Skor1Q8BX46 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Skor1Q8BX46 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Skor1Q8BX46 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Skor1Q8BX46 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Skor1Q8BX46 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Skor1Q8BX46 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Skor1Q8BX46 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Skor1Q8BX46 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Skor1Q8BX46 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Skor1Q8BX46 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Skor1Q8BX46 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Skor1Q8BX46 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Skor1Q8BX46 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Skor1Q8BX46 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Skor1Q8BX46 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Skor1Q8BX46 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Skor1Q8BX46 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Skor1Q8BX46 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Skor1Q8BX46 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Skor1Q8BX46 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Skor1Q8BX46 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Skor1Q8BX46 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Skor1Q8BX46 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Skor1Q8BX46 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Skor1Q8BX46 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Skor1Q8BX46 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Skor1Q8BX46 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Skor1Q8BX46 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Skor1Q8BX46 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Skor1Q8BX46 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Skor1Q8BX46 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Skor1Q8BX46 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Skor1Q8BX46 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Skor1Q8BX46 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Skor1Q8BX46 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Skor1Q8BX46 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Skor1Q8BX46 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Skor1Q8BX46 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Skor1Q8BX46 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Skor1Q8BX46 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Skor1Q8BX46 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Skor1Q8BX46 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Skor1Q8BX46 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Skor1Q8BX46 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Skor1Q8BX46 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Skor1Q8BX46 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Skor1Q8BX46 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Skor1Q8BX46 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Skor1Q8BX46 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Skor1Q8BX46 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Skor1Q8BX46 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Skor1Q8BX46 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Skor1Q8BX46 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Skor1Q8BX46 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Skor1Q8BX46 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Skor1Q8BX46 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Skor1Q8BX46 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Skor1Q8BX46 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Skor1Q8BX46 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Skor1Q8BX46 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Skor1Q8BX46 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Skor1Q8BX46 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Skor1Q8BX46 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Skor1Q8BX46 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Skor1Q8BX46 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Skor1Q8BX46 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Skor1Q8BX46 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Skor1Q8BX46 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Skor1Q8BX46 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Skor1Q8BX46 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Skor1Q8BX46 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Skor1Q8BX46 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Skor1Q8BX46 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Skor1Q8BX46 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Skor1Q8BX46 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Skor1Q8BX46 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Skor1Q8BX46 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Skor1Q8BX46 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Skor1Q8BX46 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Skor1Q8BX46 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms