Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT07

Cep55, Centrosomal protein of 55 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep55Q8BT07 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cep55Q8BT07 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cep55Q8BT07 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cep55Q8BT07 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cep55Q8BT07 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cep55Q8BT07 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cep55Q8BT07 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cep55Q8BT07 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cep55Q8BT07 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cep55Q8BT07 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cep55Q8BT07 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cep55Q8BT07 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cep55Q8BT07 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cep55Q8BT07 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cep55Q8BT07 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cep55Q8BT07 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cep55Q8BT07 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cep55Q8BT07 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cep55Q8BT07 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cep55Q8BT07 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cep55Q8BT07 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cep55Q8BT07 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cep55Q8BT07 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cep55Q8BT07 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cep55Q8BT07 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cep55Q8BT07 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cep55Q8BT07 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cep55Q8BT07 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cep55Q8BT07 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cep55Q8BT07 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cep55Q8BT07 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Cep55Q8BT07 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cep55Q8BT07 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cep55Q8BT07 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cep55Q8BT07 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cep55Q8BT07 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cep55Q8BT07 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cep55Q8BT07 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Cep55Q8BT07 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cep55Q8BT07 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cep55Q8BT07 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cep55Q8BT07 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cep55Q8BT07 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cep55Q8BT07 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cep55Q8BT07 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cep55Q8BT07 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cep55Q8BT07 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cep55Q8BT07 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cep55Q8BT07 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cep55Q8BT07 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cep55Q8BT07 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cep55Q8BT07 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cep55Q8BT07 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cep55Q8BT07 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cep55Q8BT07 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cep55Q8BT07 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cep55Q8BT07 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cep55Q8BT07 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cep55Q8BT07 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cep55Q8BT07 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cep55Q8BT07 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cep55Q8BT07 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cep55Q8BT07 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cep55Q8BT07 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cep55Q8BT07 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cep55Q8BT07 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cep55Q8BT07 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cep55Q8BT07 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Cep55Q8BT07 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cep55Q8BT07 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cep55Q8BT07 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cep55Q8BT07 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cep55Q8BT07 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cep55Q8BT07 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cep55Q8BT07 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cep55Q8BT07 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cep55Q8BT07 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cep55Q8BT07 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cep55Q8BT07 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Cep55Q8BT07 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cep55Q8BT07 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Cep55Q8BT07 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cep55Q8BT07 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cep55Q8BT07 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cep55Q8BT07 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cep55Q8BT07 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cep55Q8BT07 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cep55Q8BT07 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cep55Q8BT07 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Cep55Q8BT07 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cep55Q8BT07 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cep55Q8BT07 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Cep55Q8BT07 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cep55Q8BT07 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cep55Q8BT07 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cep55Q8BT07 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cep55Q8BT07 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cep55Q8BT07 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cep55Q8BT07 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cep55Q8BT07 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms