Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQC3

Igdcc3, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 3, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igdcc3Q8BQC3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Igdcc3Q8BQC3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Igdcc3Q8BQC3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Igdcc3Q8BQC3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Igdcc3Q8BQC3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Igdcc3Q8BQC3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Igdcc3Q8BQC3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Igdcc3Q8BQC3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Igdcc3Q8BQC3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Igdcc3Q8BQC3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Igdcc3Q8BQC3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Igdcc3Q8BQC3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Igdcc3Q8BQC3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Igdcc3Q8BQC3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Igdcc3Q8BQC3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Igdcc3Q8BQC3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Igdcc3Q8BQC3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Igdcc3Q8BQC3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Igdcc3Q8BQC3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Igdcc3Q8BQC3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Igdcc3Q8BQC3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Igdcc3Q8BQC3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Igdcc3Q8BQC3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Igdcc3Q8BQC3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Igdcc3Q8BQC3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Igdcc3Q8BQC3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Igdcc3Q8BQC3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Igdcc3Q8BQC3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Igdcc3Q8BQC3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Igdcc3Q8BQC3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Igdcc3Q8BQC3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Igdcc3Q8BQC3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Igdcc3Q8BQC3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Igdcc3Q8BQC3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Igdcc3Q8BQC3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Igdcc3Q8BQC3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Igdcc3Q8BQC3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Igdcc3Q8BQC3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Igdcc3Q8BQC3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Igdcc3Q8BQC3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Igdcc3Q8BQC3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Igdcc3Q8BQC3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Igdcc3Q8BQC3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Igdcc3Q8BQC3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Igdcc3Q8BQC3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Igdcc3Q8BQC3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Igdcc3Q8BQC3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Igdcc3Q8BQC3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Igdcc3Q8BQC3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Igdcc3Q8BQC3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Igdcc3Q8BQC3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Igdcc3Q8BQC3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Igdcc3Q8BQC3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Igdcc3Q8BQC3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Igdcc3Q8BQC3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Igdcc3Q8BQC3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Igdcc3Q8BQC3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Igdcc3Q8BQC3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Igdcc3Q8BQC3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Igdcc3Q8BQC3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Igdcc3Q8BQC3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Igdcc3Q8BQC3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Igdcc3Q8BQC3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Igdcc3Q8BQC3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Igdcc3Q8BQC3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Igdcc3Q8BQC3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Igdcc3Q8BQC3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Igdcc3Q8BQC3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Igdcc3Q8BQC3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Igdcc3Q8BQC3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Igdcc3Q8BQC3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Igdcc3Q8BQC3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Igdcc3Q8BQC3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Igdcc3Q8BQC3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Igdcc3Q8BQC3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Igdcc3Q8BQC3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Igdcc3Q8BQC3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Igdcc3Q8BQC3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Igdcc3Q8BQC3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Igdcc3Q8BQC3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Igdcc3Q8BQC3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Igdcc3Q8BQC3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Igdcc3Q8BQC3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Igdcc3Q8BQC3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Igdcc3Q8BQC3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Igdcc3Q8BQC3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Igdcc3Q8BQC3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Igdcc3Q8BQC3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Igdcc3Q8BQC3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Igdcc3Q8BQC3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Igdcc3Q8BQC3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Igdcc3Q8BQC3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Igdcc3Q8BQC3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Igdcc3Q8BQC3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Igdcc3Q8BQC3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Igdcc3Q8BQC3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Igdcc3Q8BQC3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Igdcc3Q8BQC3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Igdcc3Q8BQC3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Igdcc3Q8BQC3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139.9 ms