Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMG7

Rab3gap2, Rab3 GTPase-activating protein non-catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3gap2Q8BMG7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rab3gap2Q8BMG7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rab3gap2Q8BMG7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Rab3gap2Q8BMG7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rab3gap2Q8BMG7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rab3gap2Q8BMG7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rab3gap2Q8BMG7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rab3gap2Q8BMG7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rab3gap2Q8BMG7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rab3gap2Q8BMG7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rab3gap2Q8BMG7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rab3gap2Q8BMG7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rab3gap2Q8BMG7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rab3gap2Q8BMG7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rab3gap2Q8BMG7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rab3gap2Q8BMG7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rab3gap2Q8BMG7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rab3gap2Q8BMG7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rab3gap2Q8BMG7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rab3gap2Q8BMG7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rab3gap2Q8BMG7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rab3gap2Q8BMG7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rab3gap2Q8BMG7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rab3gap2Q8BMG7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rab3gap2Q8BMG7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rab3gap2Q8BMG7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rab3gap2Q8BMG7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rab3gap2Q8BMG7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rab3gap2Q8BMG7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rab3gap2Q8BMG7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Rab3gap2Q8BMG7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rab3gap2Q8BMG7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rab3gap2Q8BMG7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rab3gap2Q8BMG7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rab3gap2Q8BMG7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rab3gap2Q8BMG7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rab3gap2Q8BMG7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Rab3gap2Q8BMG7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Rab3gap2Q8BMG7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rab3gap2Q8BMG7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rab3gap2Q8BMG7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rab3gap2Q8BMG7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rab3gap2Q8BMG7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rab3gap2Q8BMG7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rab3gap2Q8BMG7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rab3gap2Q8BMG7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rab3gap2Q8BMG7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rab3gap2Q8BMG7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rab3gap2Q8BMG7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Rab3gap2Q8BMG7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rab3gap2Q8BMG7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Rab3gap2Q8BMG7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rab3gap2Q8BMG7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rab3gap2Q8BMG7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rab3gap2Q8BMG7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rab3gap2Q8BMG7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rab3gap2Q8BMG7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rab3gap2Q8BMG7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rab3gap2Q8BMG7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rab3gap2Q8BMG7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rab3gap2Q8BMG7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rab3gap2Q8BMG7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rab3gap2Q8BMG7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rab3gap2Q8BMG7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rab3gap2Q8BMG7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rab3gap2Q8BMG7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rab3gap2Q8BMG7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rab3gap2Q8BMG7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rab3gap2Q8BMG7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rab3gap2Q8BMG7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Rab3gap2Q8BMG7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rab3gap2Q8BMG7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rab3gap2Q8BMG7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rab3gap2Q8BMG7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rab3gap2Q8BMG7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rab3gap2Q8BMG7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rab3gap2Q8BMG7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rab3gap2Q8BMG7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rab3gap2Q8BMG7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rab3gap2Q8BMG7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rab3gap2Q8BMG7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rab3gap2Q8BMG7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Rab3gap2Q8BMG7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Rab3gap2Q8BMG7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Rab3gap2Q8BMG7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rab3gap2Q8BMG7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Rab3gap2Q8BMG7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rab3gap2Q8BMG7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rab3gap2Q8BMG7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rab3gap2Q8BMG7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rab3gap2Q8BMG7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rab3gap2Q8BMG7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rab3gap2Q8BMG7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rab3gap2Q8BMG7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rab3gap2Q8BMG7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rab3gap2Q8BMG7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rab3gap2Q8BMG7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rab3gap2Q8BMG7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rab3gap2Q8BMG7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rab3gap2Q8BMG7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms