Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLH7

Hirip3, HIRA-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hirip3Q8BLH7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hirip3Q8BLH7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hirip3Q8BLH7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hirip3Q8BLH7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hirip3Q8BLH7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hirip3Q8BLH7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hirip3Q8BLH7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hirip3Q8BLH7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hirip3Q8BLH7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hirip3Q8BLH7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hirip3Q8BLH7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hirip3Q8BLH7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hirip3Q8BLH7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hirip3Q8BLH7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hirip3Q8BLH7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hirip3Q8BLH7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hirip3Q8BLH7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hirip3Q8BLH7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Hirip3Q8BLH7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hirip3Q8BLH7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hirip3Q8BLH7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hirip3Q8BLH7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hirip3Q8BLH7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hirip3Q8BLH7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hirip3Q8BLH7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hirip3Q8BLH7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hirip3Q8BLH7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hirip3Q8BLH7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hirip3Q8BLH7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hirip3Q8BLH7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Hirip3Q8BLH7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hirip3Q8BLH7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hirip3Q8BLH7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hirip3Q8BLH7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hirip3Q8BLH7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hirip3Q8BLH7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hirip3Q8BLH7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hirip3Q8BLH7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hirip3Q8BLH7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Hirip3Q8BLH7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hirip3Q8BLH7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hirip3Q8BLH7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hirip3Q8BLH7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hirip3Q8BLH7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hirip3Q8BLH7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hirip3Q8BLH7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hirip3Q8BLH7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hirip3Q8BLH7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hirip3Q8BLH7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hirip3Q8BLH7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hirip3Q8BLH7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Hirip3Q8BLH7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Hirip3Q8BLH7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hirip3Q8BLH7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hirip3Q8BLH7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hirip3Q8BLH7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hirip3Q8BLH7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Hirip3Q8BLH7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hirip3Q8BLH7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hirip3Q8BLH7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hirip3Q8BLH7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hirip3Q8BLH7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hirip3Q8BLH7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hirip3Q8BLH7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hirip3Q8BLH7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hirip3Q8BLH7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Hirip3Q8BLH7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hirip3Q8BLH7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hirip3Q8BLH7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Hirip3Q8BLH7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hirip3Q8BLH7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hirip3Q8BLH7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hirip3Q8BLH7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hirip3Q8BLH7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hirip3Q8BLH7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Hirip3Q8BLH7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hirip3Q8BLH7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Hirip3Q8BLH7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hirip3Q8BLH7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hirip3Q8BLH7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hirip3Q8BLH7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hirip3Q8BLH7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hirip3Q8BLH7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hirip3Q8BLH7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hirip3Q8BLH7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hirip3Q8BLH7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hirip3Q8BLH7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hirip3Q8BLH7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hirip3Q8BLH7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hirip3Q8BLH7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Hirip3Q8BLH7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hirip3Q8BLH7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hirip3Q8BLH7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hirip3Q8BLH7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hirip3Q8BLH7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hirip3Q8BLH7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hirip3Q8BLH7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hirip3Q8BLH7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hirip3Q8BLH7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hirip3Q8BLH7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms