Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vipas39Q8BGQ1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vipas39Q8BGQ1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Vipas39Q8BGQ1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vipas39Q8BGQ1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vipas39Q8BGQ1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vipas39Q8BGQ1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vipas39Q8BGQ1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vipas39Q8BGQ1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Vipas39Q8BGQ1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vipas39Q8BGQ1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vipas39Q8BGQ1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vipas39Q8BGQ1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vipas39Q8BGQ1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vipas39Q8BGQ1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vipas39Q8BGQ1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vipas39Q8BGQ1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vipas39Q8BGQ1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vipas39Q8BGQ1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vipas39Q8BGQ1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vipas39Q8BGQ1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vipas39Q8BGQ1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vipas39Q8BGQ1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vipas39Q8BGQ1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vipas39Q8BGQ1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vipas39Q8BGQ1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vipas39Q8BGQ1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vipas39Q8BGQ1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vipas39Q8BGQ1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vipas39Q8BGQ1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vipas39Q8BGQ1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vipas39Q8BGQ1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vipas39Q8BGQ1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vipas39Q8BGQ1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vipas39Q8BGQ1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vipas39Q8BGQ1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vipas39Q8BGQ1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vipas39Q8BGQ1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vipas39Q8BGQ1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vipas39Q8BGQ1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vipas39Q8BGQ1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vipas39Q8BGQ1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vipas39Q8BGQ1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vipas39Q8BGQ1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vipas39Q8BGQ1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vipas39Q8BGQ1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Vipas39Q8BGQ1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vipas39Q8BGQ1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vipas39Q8BGQ1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vipas39Q8BGQ1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vipas39Q8BGQ1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vipas39Q8BGQ1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vipas39Q8BGQ1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vipas39Q8BGQ1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vipas39Q8BGQ1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vipas39Q8BGQ1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vipas39Q8BGQ1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vipas39Q8BGQ1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vipas39Q8BGQ1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vipas39Q8BGQ1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vipas39Q8BGQ1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vipas39Q8BGQ1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vipas39Q8BGQ1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vipas39Q8BGQ1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vipas39Q8BGQ1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vipas39Q8BGQ1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vipas39Q8BGQ1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vipas39Q8BGQ1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vipas39Q8BGQ1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vipas39Q8BGQ1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vipas39Q8BGQ1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vipas39Q8BGQ1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vipas39Q8BGQ1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vipas39Q8BGQ1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Vipas39Q8BGQ1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vipas39Q8BGQ1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vipas39Q8BGQ1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vipas39Q8BGQ1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vipas39Q8BGQ1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vipas39Q8BGQ1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vipas39Q8BGQ1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vipas39Q8BGQ1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vipas39Q8BGQ1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vipas39Q8BGQ1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vipas39Q8BGQ1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vipas39Q8BGQ1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vipas39Q8BGQ1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vipas39Q8BGQ1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vipas39Q8BGQ1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vipas39Q8BGQ1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vipas39Q8BGQ1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vipas39Q8BGQ1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vipas39Q8BGQ1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vipas39Q8BGQ1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vipas39Q8BGQ1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vipas39Q8BGQ1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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