Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGN9

Uncharacterized protein C1orf115 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGN9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q8BGN9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q8BGN9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q8BGN9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Q8BGN9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q8BGN9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q8BGN9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q8BGN9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q8BGN9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q8BGN9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Q8BGN9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q8BGN9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q8BGN9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q8BGN9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q8BGN9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q8BGN9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q8BGN9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q8BGN9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q8BGN9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q8BGN9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q8BGN9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q8BGN9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q8BGN9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q8BGN9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q8BGN9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q8BGN9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q8BGN9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q8BGN9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q8BGN9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q8BGN9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q8BGN9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q8BGN9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q8BGN9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q8BGN9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q8BGN9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q8BGN9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q8BGN9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q8BGN9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q8BGN9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q8BGN9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q8BGN9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q8BGN9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q8BGN9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q8BGN9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q8BGN9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q8BGN9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q8BGN9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q8BGN9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q8BGN9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q8BGN9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q8BGN9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q8BGN9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q8BGN9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q8BGN9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q8BGN9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q8BGN9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Q8BGN9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q8BGN9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q8BGN9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q8BGN9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q8BGN9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q8BGN9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q8BGN9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Q8BGN9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q8BGN9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q8BGN9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q8BGN9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q8BGN9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q8BGN9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q8BGN9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q8BGN9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q8BGN9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q8BGN9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q8BGN9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q8BGN9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Q8BGN9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q8BGN9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Q8BGN9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Q8BGN9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q8BGN9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q8BGN9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q8BGN9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q8BGN9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q8BGN9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q8BGN9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q8BGN9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q8BGN9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q8BGN9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q8BGN9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q8BGN9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q8BGN9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q8BGN9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q8BGN9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q8BGN9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q8BGN9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q8BGN9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q8BGN9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q8BGN9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q8BGN9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q8BGN9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms