Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG99

Pknox2, Homeobox protein PKNOX2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pknox2Q8BG99 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pknox2Q8BG99 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pknox2Q8BG99 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pknox2Q8BG99 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pknox2Q8BG99 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pknox2Q8BG99 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pknox2Q8BG99 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pknox2Q8BG99 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pknox2Q8BG99 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pknox2Q8BG99 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pknox2Q8BG99 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pknox2Q8BG99 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pknox2Q8BG99 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pknox2Q8BG99 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pknox2Q8BG99 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pknox2Q8BG99 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Pknox2Q8BG99 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pknox2Q8BG99 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pknox2Q8BG99 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pknox2Q8BG99 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Pknox2Q8BG99 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pknox2Q8BG99 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pknox2Q8BG99 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pknox2Q8BG99 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pknox2Q8BG99 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pknox2Q8BG99 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pknox2Q8BG99 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pknox2Q8BG99 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pknox2Q8BG99 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pknox2Q8BG99 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pknox2Q8BG99 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pknox2Q8BG99 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pknox2Q8BG99 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pknox2Q8BG99 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pknox2Q8BG99 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pknox2Q8BG99 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pknox2Q8BG99 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pknox2Q8BG99 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pknox2Q8BG99 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pknox2Q8BG99 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pknox2Q8BG99 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pknox2Q8BG99 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Pknox2Q8BG99 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pknox2Q8BG99 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pknox2Q8BG99 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pknox2Q8BG99 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pknox2Q8BG99 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pknox2Q8BG99 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pknox2Q8BG99 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pknox2Q8BG99 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pknox2Q8BG99 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pknox2Q8BG99 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Pknox2Q8BG99 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Pknox2Q8BG99 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pknox2Q8BG99 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pknox2Q8BG99 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pknox2Q8BG99 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pknox2Q8BG99 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pknox2Q8BG99 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pknox2Q8BG99 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pknox2Q8BG99 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pknox2Q8BG99 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pknox2Q8BG99 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pknox2Q8BG99 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pknox2Q8BG99 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pknox2Q8BG99 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pknox2Q8BG99 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pknox2Q8BG99 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pknox2Q8BG99 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pknox2Q8BG99 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pknox2Q8BG99 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pknox2Q8BG99 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pknox2Q8BG99 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pknox2Q8BG99 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pknox2Q8BG99 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pknox2Q8BG99 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pknox2Q8BG99 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pknox2Q8BG99 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pknox2Q8BG99 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pknox2Q8BG99 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pknox2Q8BG99 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pknox2Q8BG99 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pknox2Q8BG99 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pknox2Q8BG99 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pknox2Q8BG99 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pknox2Q8BG99 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pknox2Q8BG99 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pknox2Q8BG99 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pknox2Q8BG99 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Pknox2Q8BG99 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pknox2Q8BG99 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pknox2Q8BG99 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pknox2Q8BG99 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pknox2Q8BG99 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pknox2Q8BG99 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pknox2Q8BG99 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pknox2Q8BG99 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pknox2Q8BG99 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pknox2Q8BG99 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pknox2Q8BG99 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms