Protein–RNA interactions for Protein: Q812A2

Srgap3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srgap3Q812A2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Srgap3Q812A2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Srgap3Q812A2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Srgap3Q812A2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Srgap3Q812A2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Srgap3Q812A2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Srgap3Q812A2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Srgap3Q812A2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Srgap3Q812A2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Srgap3Q812A2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Srgap3Q812A2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Srgap3Q812A2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Srgap3Q812A2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Srgap3Q812A2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Srgap3Q812A2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Srgap3Q812A2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Srgap3Q812A2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Srgap3Q812A2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Srgap3Q812A2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Srgap3Q812A2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Srgap3Q812A2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Srgap3Q812A2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Srgap3Q812A2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Srgap3Q812A2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Srgap3Q812A2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Srgap3Q812A2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Srgap3Q812A2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Srgap3Q812A2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Srgap3Q812A2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Srgap3Q812A2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Srgap3Q812A2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Srgap3Q812A2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Srgap3Q812A2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Srgap3Q812A2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Srgap3Q812A2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Srgap3Q812A2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Srgap3Q812A2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Srgap3Q812A2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Srgap3Q812A2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Srgap3Q812A2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Srgap3Q812A2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Srgap3Q812A2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Srgap3Q812A2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Srgap3Q812A2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Srgap3Q812A2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Srgap3Q812A2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Srgap3Q812A2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Srgap3Q812A2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Srgap3Q812A2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Srgap3Q812A2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Srgap3Q812A2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Srgap3Q812A2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Srgap3Q812A2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Srgap3Q812A2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Srgap3Q812A2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Srgap3Q812A2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Srgap3Q812A2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Srgap3Q812A2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Srgap3Q812A2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Srgap3Q812A2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Srgap3Q812A2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Srgap3Q812A2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Srgap3Q812A2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Srgap3Q812A2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Srgap3Q812A2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Srgap3Q812A2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Srgap3Q812A2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Srgap3Q812A2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Srgap3Q812A2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Srgap3Q812A2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Srgap3Q812A2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Srgap3Q812A2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Srgap3Q812A2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Srgap3Q812A2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Srgap3Q812A2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Srgap3Q812A2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Srgap3Q812A2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Srgap3Q812A2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Srgap3Q812A2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Srgap3Q812A2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Srgap3Q812A2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Srgap3Q812A2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Srgap3Q812A2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Srgap3Q812A2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Srgap3Q812A2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Srgap3Q812A2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Srgap3Q812A2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Srgap3Q812A2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Srgap3Q812A2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Srgap3Q812A2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Srgap3Q812A2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Srgap3Q812A2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Srgap3Q812A2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Srgap3Q812A2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Srgap3Q812A2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Srgap3Q812A2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Srgap3Q812A2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Srgap3Q812A2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Srgap3Q812A2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Srgap3Q812A2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms