Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NfascQ810U3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NfascQ810U3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NfascQ810U3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NfascQ810U3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NfascQ810U3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NfascQ810U3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NfascQ810U3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NfascQ810U3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NfascQ810U3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NfascQ810U3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NfascQ810U3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NfascQ810U3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NfascQ810U3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NfascQ810U3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NfascQ810U3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NfascQ810U3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NfascQ810U3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NfascQ810U3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NfascQ810U3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NfascQ810U3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NfascQ810U3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NfascQ810U3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NfascQ810U3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NfascQ810U3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NfascQ810U3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NfascQ810U3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NfascQ810U3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NfascQ810U3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NfascQ810U3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NfascQ810U3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NfascQ810U3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NfascQ810U3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NfascQ810U3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
NfascQ810U3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NfascQ810U3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NfascQ810U3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NfascQ810U3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NfascQ810U3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NfascQ810U3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NfascQ810U3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NfascQ810U3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NfascQ810U3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NfascQ810U3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NfascQ810U3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NfascQ810U3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NfascQ810U3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NfascQ810U3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NfascQ810U3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NfascQ810U3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NfascQ810U3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NfascQ810U3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NfascQ810U3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NfascQ810U3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NfascQ810U3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NfascQ810U3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NfascQ810U3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NfascQ810U3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NfascQ810U3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NfascQ810U3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NfascQ810U3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NfascQ810U3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NfascQ810U3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NfascQ810U3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NfascQ810U3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
NfascQ810U3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NfascQ810U3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NfascQ810U3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NfascQ810U3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NfascQ810U3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NfascQ810U3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NfascQ810U3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NfascQ810U3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NfascQ810U3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NfascQ810U3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NfascQ810U3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NfascQ810U3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NfascQ810U3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NfascQ810U3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NfascQ810U3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NfascQ810U3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NfascQ810U3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NfascQ810U3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NfascQ810U3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NfascQ810U3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NfascQ810U3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NfascQ810U3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NfascQ810U3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NfascQ810U3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NfascQ810U3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NfascQ810U3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NfascQ810U3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NfascQ810U3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NfascQ810U3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NfascQ810U3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NfascQ810U3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NfascQ810U3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NfascQ810U3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NfascQ810U3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NfascQ810U3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms