Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ChfrQ810L3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ChfrQ810L3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ChfrQ810L3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ChfrQ810L3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ChfrQ810L3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ChfrQ810L3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ChfrQ810L3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ChfrQ810L3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ChfrQ810L3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ChfrQ810L3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ChfrQ810L3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ChfrQ810L3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ChfrQ810L3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ChfrQ810L3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ChfrQ810L3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ChfrQ810L3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ChfrQ810L3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ChfrQ810L3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ChfrQ810L3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ChfrQ810L3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ChfrQ810L3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ChfrQ810L3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ChfrQ810L3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ChfrQ810L3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ChfrQ810L3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ChfrQ810L3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.87
ChfrQ810L3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ChfrQ810L3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ChfrQ810L3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ChfrQ810L3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ChfrQ810L3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ChfrQ810L3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ChfrQ810L3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ChfrQ810L3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ChfrQ810L3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ChfrQ810L3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ChfrQ810L3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ChfrQ810L3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ChfrQ810L3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ChfrQ810L3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ChfrQ810L3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ChfrQ810L3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ChfrQ810L3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ChfrQ810L3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ChfrQ810L3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ChfrQ810L3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ChfrQ810L3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ChfrQ810L3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ChfrQ810L3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ChfrQ810L3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ChfrQ810L3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ChfrQ810L3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ChfrQ810L3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ChfrQ810L3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ChfrQ810L3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ChfrQ810L3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChfrQ810L3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChfrQ810L3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChfrQ810L3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChfrQ810L3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChfrQ810L3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChfrQ810L3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChfrQ810L3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChfrQ810L3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChfrQ810L3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChfrQ810L3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChfrQ810L3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChfrQ810L3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChfrQ810L3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChfrQ810L3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChfrQ810L3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChfrQ810L3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChfrQ810L3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChfrQ810L3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChfrQ810L3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChfrQ810L3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChfrQ810L3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChfrQ810L3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChfrQ810L3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChfrQ810L3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ChfrQ810L3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChfrQ810L3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChfrQ810L3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ChfrQ810L3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ChfrQ810L3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ChfrQ810L3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ChfrQ810L3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ChfrQ810L3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ChfrQ810L3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ChfrQ810L3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ChfrQ810L3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ChfrQ810L3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ChfrQ810L3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ChfrQ810L3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ChfrQ810L3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ChfrQ810L3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ChfrQ810L3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ChfrQ810L3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ChfrQ810L3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms