Protein–RNA interactions for Protein: Q80WR1

Tspan18, Tetraspanin-18, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan18Q80WR1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
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Tspan18Q80WR1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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Tspan18Q80WR1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tspan18Q80WR1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tspan18Q80WR1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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Tspan18Q80WR1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tspan18Q80WR1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Tspan18Q80WR1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Tspan18Q80WR1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tspan18Q80WR1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tspan18Q80WR1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tspan18Q80WR1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tspan18Q80WR1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tspan18Q80WR1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tspan18Q80WR1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tspan18Q80WR1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Tspan18Q80WR1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tspan18Q80WR1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tspan18Q80WR1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tspan18Q80WR1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tspan18Q80WR1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tspan18Q80WR1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tspan18Q80WR1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tspan18Q80WR1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tspan18Q80WR1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tspan18Q80WR1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
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