Protein–RNA interactions for Protein: Q80UW8

Polr2e, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2eQ80UW8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Polr2eQ80UW8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Polr2eQ80UW8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Polr2eQ80UW8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Polr2eQ80UW8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Polr2eQ80UW8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Polr2eQ80UW8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Polr2eQ80UW8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Polr2eQ80UW8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Polr2eQ80UW8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Polr2eQ80UW8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Polr2eQ80UW8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Polr2eQ80UW8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Polr2eQ80UW8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Polr2eQ80UW8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Polr2eQ80UW8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Polr2eQ80UW8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Polr2eQ80UW8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Polr2eQ80UW8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Polr2eQ80UW8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Polr2eQ80UW8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Polr2eQ80UW8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Polr2eQ80UW8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Polr2eQ80UW8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Polr2eQ80UW8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Polr2eQ80UW8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Polr2eQ80UW8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Polr2eQ80UW8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Polr2eQ80UW8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Polr2eQ80UW8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Polr2eQ80UW8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Polr2eQ80UW8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Polr2eQ80UW8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Polr2eQ80UW8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Polr2eQ80UW8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Polr2eQ80UW8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Polr2eQ80UW8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Polr2eQ80UW8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Polr2eQ80UW8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Polr2eQ80UW8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Polr2eQ80UW8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Polr2eQ80UW8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Polr2eQ80UW8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Polr2eQ80UW8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Polr2eQ80UW8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Polr2eQ80UW8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Polr2eQ80UW8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Polr2eQ80UW8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Polr2eQ80UW8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Polr2eQ80UW8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Polr2eQ80UW8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Polr2eQ80UW8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Polr2eQ80UW8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Polr2eQ80UW8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Polr2eQ80UW8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Polr2eQ80UW8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Polr2eQ80UW8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Polr2eQ80UW8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Polr2eQ80UW8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Polr2eQ80UW8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Polr2eQ80UW8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Polr2eQ80UW8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Polr2eQ80UW8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Polr2eQ80UW8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Polr2eQ80UW8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Polr2eQ80UW8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Polr2eQ80UW8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Polr2eQ80UW8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Polr2eQ80UW8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Polr2eQ80UW8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Polr2eQ80UW8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Polr2eQ80UW8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Polr2eQ80UW8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Polr2eQ80UW8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Polr2eQ80UW8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Polr2eQ80UW8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Polr2eQ80UW8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Polr2eQ80UW8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Polr2eQ80UW8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Polr2eQ80UW8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Polr2eQ80UW8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Polr2eQ80UW8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Polr2eQ80UW8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Polr2eQ80UW8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Polr2eQ80UW8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Polr2eQ80UW8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Polr2eQ80UW8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Polr2eQ80UW8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Polr2eQ80UW8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Polr2eQ80UW8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Polr2eQ80UW8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Polr2eQ80UW8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Polr2eQ80UW8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Polr2eQ80UW8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Polr2eQ80UW8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Polr2eQ80UW8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Polr2eQ80UW8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Polr2eQ80UW8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Polr2eQ80UW8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Polr2eQ80UW8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.9 ms