Protein–RNA interactions for Protein: Q80T74

Klhl29, Kelch-like protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl29Q80T74 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Klhl29Q80T74 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Klhl29Q80T74 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klhl29Q80T74 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klhl29Q80T74 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klhl29Q80T74 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klhl29Q80T74 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klhl29Q80T74 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klhl29Q80T74 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klhl29Q80T74 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klhl29Q80T74 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klhl29Q80T74 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klhl29Q80T74 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Klhl29Q80T74 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Klhl29Q80T74 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Klhl29Q80T74 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Klhl29Q80T74 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Klhl29Q80T74 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Klhl29Q80T74 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Klhl29Q80T74 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Klhl29Q80T74 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Klhl29Q80T74 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Klhl29Q80T74 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Klhl29Q80T74 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Klhl29Q80T74 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Klhl29Q80T74 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Klhl29Q80T74 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Klhl29Q80T74 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Klhl29Q80T74 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Klhl29Q80T74 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Klhl29Q80T74 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Klhl29Q80T74 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klhl29Q80T74 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klhl29Q80T74 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klhl29Q80T74 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klhl29Q80T74 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Klhl29Q80T74 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klhl29Q80T74 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klhl29Q80T74 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klhl29Q80T74 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Klhl29Q80T74 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Klhl29Q80T74 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Klhl29Q80T74 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klhl29Q80T74 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klhl29Q80T74 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klhl29Q80T74 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klhl29Q80T74 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klhl29Q80T74 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klhl29Q80T74 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klhl29Q80T74 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klhl29Q80T74 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klhl29Q80T74 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klhl29Q80T74 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klhl29Q80T74 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klhl29Q80T74 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klhl29Q80T74 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klhl29Q80T74 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klhl29Q80T74 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klhl29Q80T74 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klhl29Q80T74 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klhl29Q80T74 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klhl29Q80T74 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klhl29Q80T74 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klhl29Q80T74 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klhl29Q80T74 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klhl29Q80T74 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klhl29Q80T74 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klhl29Q80T74 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klhl29Q80T74 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klhl29Q80T74 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Klhl29Q80T74 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klhl29Q80T74 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klhl29Q80T74 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klhl29Q80T74 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klhl29Q80T74 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klhl29Q80T74 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klhl29Q80T74 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klhl29Q80T74 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klhl29Q80T74 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klhl29Q80T74 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klhl29Q80T74 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhl29Q80T74 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhl29Q80T74 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhl29Q80T74 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhl29Q80T74 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhl29Q80T74 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhl29Q80T74 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhl29Q80T74 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhl29Q80T74 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Klhl29Q80T74 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Klhl29Q80T74 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Klhl29Q80T74 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Klhl29Q80T74 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Klhl29Q80T74 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Klhl29Q80T74 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klhl29Q80T74 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klhl29Q80T74 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klhl29Q80T74 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klhl29Q80T74 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klhl29Q80T74 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms