Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ClmQ7TSN2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ClmQ7TSN2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ClmQ7TSN2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ClmQ7TSN2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ClmQ7TSN2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ClmQ7TSN2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ClmQ7TSN2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ClmQ7TSN2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ClmQ7TSN2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ClmQ7TSN2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ClmQ7TSN2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ClmQ7TSN2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ClmQ7TSN2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ClmQ7TSN2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ClmQ7TSN2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ClmQ7TSN2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ClmQ7TSN2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ClmQ7TSN2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ClmQ7TSN2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ClmQ7TSN2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ClmQ7TSN2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ClmQ7TSN2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ClmQ7TSN2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ClmQ7TSN2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ClmQ7TSN2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ClmQ7TSN2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ClmQ7TSN2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ClmQ7TSN2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ClmQ7TSN2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ClmQ7TSN2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ClmQ7TSN2 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ClmQ7TSN2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ClmQ7TSN2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ClmQ7TSN2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ClmQ7TSN2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ClmQ7TSN2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ClmQ7TSN2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ClmQ7TSN2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ClmQ7TSN2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ClmQ7TSN2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ClmQ7TSN2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ClmQ7TSN2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ClmQ7TSN2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ClmQ7TSN2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ClmQ7TSN2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ClmQ7TSN2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ClmQ7TSN2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ClmQ7TSN2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ClmQ7TSN2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ClmQ7TSN2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ClmQ7TSN2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ClmQ7TSN2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ClmQ7TSN2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ClmQ7TSN2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ClmQ7TSN2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ClmQ7TSN2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ClmQ7TSN2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ClmQ7TSN2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ClmQ7TSN2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ClmQ7TSN2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ClmQ7TSN2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ClmQ7TSN2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ClmQ7TSN2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ClmQ7TSN2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ClmQ7TSN2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ClmQ7TSN2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ClmQ7TSN2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ClmQ7TSN2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ClmQ7TSN2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ClmQ7TSN2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ClmQ7TSN2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ClmQ7TSN2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ClmQ7TSN2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ClmQ7TSN2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ClmQ7TSN2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ClmQ7TSN2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ClmQ7TSN2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ClmQ7TSN2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ClmQ7TSN2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ClmQ7TSN2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ClmQ7TSN2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ClmQ7TSN2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ClmQ7TSN2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ClmQ7TSN2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ClmQ7TSN2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ClmQ7TSN2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ClmQ7TSN2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ClmQ7TSN2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ClmQ7TSN2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ClmQ7TSN2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ClmQ7TSN2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ClmQ7TSN2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ClmQ7TSN2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ClmQ7TSN2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ClmQ7TSN2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ClmQ7TSN2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ClmQ7TSN2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ClmQ7TSN2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ClmQ7TSN2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms