Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nphp3Q7TNH6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nphp3Q7TNH6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nphp3Q7TNH6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nphp3Q7TNH6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nphp3Q7TNH6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nphp3Q7TNH6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nphp3Q7TNH6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nphp3Q7TNH6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nphp3Q7TNH6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Nphp3Q7TNH6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nphp3Q7TNH6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nphp3Q7TNH6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nphp3Q7TNH6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nphp3Q7TNH6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nphp3Q7TNH6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nphp3Q7TNH6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nphp3Q7TNH6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nphp3Q7TNH6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Nphp3Q7TNH6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nphp3Q7TNH6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Nphp3Q7TNH6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nphp3Q7TNH6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nphp3Q7TNH6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nphp3Q7TNH6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nphp3Q7TNH6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nphp3Q7TNH6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nphp3Q7TNH6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nphp3Q7TNH6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nphp3Q7TNH6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nphp3Q7TNH6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nphp3Q7TNH6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nphp3Q7TNH6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nphp3Q7TNH6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Nphp3Q7TNH6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nphp3Q7TNH6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nphp3Q7TNH6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nphp3Q7TNH6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nphp3Q7TNH6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nphp3Q7TNH6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nphp3Q7TNH6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nphp3Q7TNH6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Nphp3Q7TNH6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nphp3Q7TNH6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nphp3Q7TNH6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Nphp3Q7TNH6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nphp3Q7TNH6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nphp3Q7TNH6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nphp3Q7TNH6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nphp3Q7TNH6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nphp3Q7TNH6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nphp3Q7TNH6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nphp3Q7TNH6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nphp3Q7TNH6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nphp3Q7TNH6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nphp3Q7TNH6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nphp3Q7TNH6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nphp3Q7TNH6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nphp3Q7TNH6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nphp3Q7TNH6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nphp3Q7TNH6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nphp3Q7TNH6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nphp3Q7TNH6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nphp3Q7TNH6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nphp3Q7TNH6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nphp3Q7TNH6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nphp3Q7TNH6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nphp3Q7TNH6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nphp3Q7TNH6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nphp3Q7TNH6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nphp3Q7TNH6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nphp3Q7TNH6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nphp3Q7TNH6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nphp3Q7TNH6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Nphp3Q7TNH6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Nphp3Q7TNH6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nphp3Q7TNH6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nphp3Q7TNH6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Nphp3Q7TNH6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nphp3Q7TNH6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nphp3Q7TNH6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nphp3Q7TNH6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nphp3Q7TNH6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nphp3Q7TNH6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nphp3Q7TNH6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nphp3Q7TNH6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nphp3Q7TNH6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nphp3Q7TNH6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nphp3Q7TNH6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nphp3Q7TNH6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nphp3Q7TNH6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nphp3Q7TNH6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nphp3Q7TNH6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nphp3Q7TNH6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nphp3Q7TNH6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nphp3Q7TNH6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nphp3Q7TNH6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nphp3Q7TNH6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nphp3Q7TNH6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nphp3Q7TNH6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms