Protein–RNA interactions for Protein: Q76I79

Ssh1, Protein phosphatase Slingshot homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh1Q76I79 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ssh1Q76I79 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ssh1Q76I79 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ssh1Q76I79 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ssh1Q76I79 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ssh1Q76I79 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ssh1Q76I79 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ssh1Q76I79 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ssh1Q76I79 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ssh1Q76I79 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ssh1Q76I79 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ssh1Q76I79 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ssh1Q76I79 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ssh1Q76I79 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ssh1Q76I79 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ssh1Q76I79 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ssh1Q76I79 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ssh1Q76I79 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ssh1Q76I79 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ssh1Q76I79 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ssh1Q76I79 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ssh1Q76I79 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ssh1Q76I79 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ssh1Q76I79 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ssh1Q76I79 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ssh1Q76I79 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ssh1Q76I79 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ssh1Q76I79 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ssh1Q76I79 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ssh1Q76I79 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ssh1Q76I79 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ssh1Q76I79 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ssh1Q76I79 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ssh1Q76I79 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ssh1Q76I79 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ssh1Q76I79 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ssh1Q76I79 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ssh1Q76I79 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ssh1Q76I79 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ssh1Q76I79 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ssh1Q76I79 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ssh1Q76I79 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ssh1Q76I79 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ssh1Q76I79 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ssh1Q76I79 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ssh1Q76I79 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ssh1Q76I79 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ssh1Q76I79 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ssh1Q76I79 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ssh1Q76I79 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ssh1Q76I79 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ssh1Q76I79 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ssh1Q76I79 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ssh1Q76I79 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ssh1Q76I79 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ssh1Q76I79 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ssh1Q76I79 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ssh1Q76I79 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ssh1Q76I79 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ssh1Q76I79 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ssh1Q76I79 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ssh1Q76I79 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ssh1Q76I79 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ssh1Q76I79 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ssh1Q76I79 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ssh1Q76I79 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ssh1Q76I79 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ssh1Q76I79 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ssh1Q76I79 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ssh1Q76I79 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ssh1Q76I79 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ssh1Q76I79 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ssh1Q76I79 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ssh1Q76I79 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ssh1Q76I79 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ssh1Q76I79 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ssh1Q76I79 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ssh1Q76I79 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ssh1Q76I79 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ssh1Q76I79 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ssh1Q76I79 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ssh1Q76I79 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ssh1Q76I79 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ssh1Q76I79 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ssh1Q76I79 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ssh1Q76I79 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ssh1Q76I79 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ssh1Q76I79 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Ssh1Q76I79 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ssh1Q76I79 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ssh1Q76I79 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ssh1Q76I79 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ssh1Q76I79 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ssh1Q76I79 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ssh1Q76I79 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ssh1Q76I79 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ssh1Q76I79 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ssh1Q76I79 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ssh1Q76I79 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ssh1Q76I79 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms