Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Higd1cQ76I25 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Higd1cQ76I25 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Higd1cQ76I25 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Higd1cQ76I25 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Higd1cQ76I25 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Higd1cQ76I25 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Higd1cQ76I25 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Higd1cQ76I25 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Higd1cQ76I25 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Higd1cQ76I25 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Higd1cQ76I25 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Higd1cQ76I25 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Higd1cQ76I25 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Higd1cQ76I25 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Higd1cQ76I25 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Higd1cQ76I25 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Higd1cQ76I25 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Higd1cQ76I25 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Higd1cQ76I25 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Higd1cQ76I25 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Higd1cQ76I25 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Higd1cQ76I25 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Higd1cQ76I25 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Higd1cQ76I25 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Higd1cQ76I25 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Higd1cQ76I25 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Higd1cQ76I25 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Higd1cQ76I25 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Higd1cQ76I25 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Higd1cQ76I25 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Higd1cQ76I25 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Higd1cQ76I25 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Higd1cQ76I25 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Higd1cQ76I25 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Higd1cQ76I25 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Higd1cQ76I25 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Higd1cQ76I25 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Higd1cQ76I25 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Higd1cQ76I25 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Higd1cQ76I25 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Higd1cQ76I25 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Higd1cQ76I25 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Higd1cQ76I25 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Higd1cQ76I25 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Higd1cQ76I25 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Higd1cQ76I25 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Higd1cQ76I25 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Higd1cQ76I25 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Higd1cQ76I25 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Higd1cQ76I25 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Higd1cQ76I25 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Higd1cQ76I25 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Higd1cQ76I25 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Higd1cQ76I25 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Higd1cQ76I25 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Higd1cQ76I25 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Higd1cQ76I25 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Higd1cQ76I25 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Higd1cQ76I25 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Higd1cQ76I25 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Higd1cQ76I25 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Higd1cQ76I25 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Higd1cQ76I25 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Higd1cQ76I25 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Higd1cQ76I25 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Higd1cQ76I25 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Higd1cQ76I25 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Higd1cQ76I25 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Higd1cQ76I25 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Higd1cQ76I25 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Higd1cQ76I25 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Higd1cQ76I25 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Higd1cQ76I25 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Higd1cQ76I25 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Higd1cQ76I25 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Higd1cQ76I25 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Higd1cQ76I25 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Higd1cQ76I25 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Higd1cQ76I25 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Higd1cQ76I25 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Higd1cQ76I25 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Higd1cQ76I25 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Higd1cQ76I25 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Higd1cQ76I25 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Higd1cQ76I25 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Higd1cQ76I25 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Higd1cQ76I25 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Higd1cQ76I25 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Higd1cQ76I25 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Higd1cQ76I25 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Higd1cQ76I25 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Higd1cQ76I25 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Higd1cQ76I25 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Higd1cQ76I25 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Higd1cQ76I25 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Higd1cQ76I25 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Higd1cQ76I25 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Higd1cQ76I25 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Higd1cQ76I25 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms