Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWV7

Rpl35, 60S ribosomal protein L35, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35Q6ZWV7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl35Q6ZWV7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl35Q6ZWV7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl35Q6ZWV7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl35Q6ZWV7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl35Q6ZWV7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl35Q6ZWV7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl35Q6ZWV7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl35Q6ZWV7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl35Q6ZWV7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl35Q6ZWV7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl35Q6ZWV7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl35Q6ZWV7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl35Q6ZWV7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl35Q6ZWV7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl35Q6ZWV7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl35Q6ZWV7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl35Q6ZWV7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl35Q6ZWV7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl35Q6ZWV7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl35Q6ZWV7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl35Q6ZWV7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl35Q6ZWV7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl35Q6ZWV7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl35Q6ZWV7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl35Q6ZWV7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl35Q6ZWV7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl35Q6ZWV7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl35Q6ZWV7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl35Q6ZWV7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rpl35Q6ZWV7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl35Q6ZWV7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl35Q6ZWV7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl35Q6ZWV7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl35Q6ZWV7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl35Q6ZWV7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl35Q6ZWV7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl35Q6ZWV7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl35Q6ZWV7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl35Q6ZWV7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl35Q6ZWV7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpl35Q6ZWV7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpl35Q6ZWV7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpl35Q6ZWV7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpl35Q6ZWV7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpl35Q6ZWV7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpl35Q6ZWV7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpl35Q6ZWV7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpl35Q6ZWV7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpl35Q6ZWV7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpl35Q6ZWV7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpl35Q6ZWV7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpl35Q6ZWV7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpl35Q6ZWV7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpl35Q6ZWV7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpl35Q6ZWV7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpl35Q6ZWV7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpl35Q6ZWV7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpl35Q6ZWV7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpl35Q6ZWV7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpl35Q6ZWV7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpl35Q6ZWV7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpl35Q6ZWV7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpl35Q6ZWV7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpl35Q6ZWV7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpl35Q6ZWV7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpl35Q6ZWV7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpl35Q6ZWV7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpl35Q6ZWV7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpl35Q6ZWV7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpl35Q6ZWV7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpl35Q6ZWV7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpl35Q6ZWV7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpl35Q6ZWV7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpl35Q6ZWV7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpl35Q6ZWV7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpl35Q6ZWV7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpl35Q6ZWV7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpl35Q6ZWV7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpl35Q6ZWV7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpl35Q6ZWV7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpl35Q6ZWV7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpl35Q6ZWV7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpl35Q6ZWV7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpl35Q6ZWV7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpl35Q6ZWV7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rpl35Q6ZWV7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rpl35Q6ZWV7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rpl35Q6ZWV7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rpl35Q6ZWV7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rpl35Q6ZWV7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rpl35Q6ZWV7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rpl35Q6ZWV7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rpl35Q6ZWV7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rpl35Q6ZWV7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rpl35Q6ZWV7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Rpl35Q6ZWV7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rpl35Q6ZWV7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rpl35Q6ZWV7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rpl35Q6ZWV7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms