Protein–RNA interactions for Protein: Q6W8Q3

Pcp4l1, Purkinje cell protein 4-like protein 1, mousemouse

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Length 68 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcp4l1Q6W8Q3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pcp4l1Q6W8Q3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pcp4l1Q6W8Q3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pcp4l1Q6W8Q3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pcp4l1Q6W8Q3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pcp4l1Q6W8Q3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pcp4l1Q6W8Q3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pcp4l1Q6W8Q3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pcp4l1Q6W8Q3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pcp4l1Q6W8Q3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pcp4l1Q6W8Q3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pcp4l1Q6W8Q3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pcp4l1Q6W8Q3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pcp4l1Q6W8Q3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pcp4l1Q6W8Q3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pcp4l1Q6W8Q3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pcp4l1Q6W8Q3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pcp4l1Q6W8Q3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pcp4l1Q6W8Q3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pcp4l1Q6W8Q3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pcp4l1Q6W8Q3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pcp4l1Q6W8Q3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pcp4l1Q6W8Q3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pcp4l1Q6W8Q3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pcp4l1Q6W8Q3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pcp4l1Q6W8Q3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pcp4l1Q6W8Q3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pcp4l1Q6W8Q3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pcp4l1Q6W8Q3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pcp4l1Q6W8Q3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pcp4l1Q6W8Q3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pcp4l1Q6W8Q3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pcp4l1Q6W8Q3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pcp4l1Q6W8Q3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pcp4l1Q6W8Q3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pcp4l1Q6W8Q3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pcp4l1Q6W8Q3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pcp4l1Q6W8Q3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pcp4l1Q6W8Q3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pcp4l1Q6W8Q3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pcp4l1Q6W8Q3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pcp4l1Q6W8Q3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pcp4l1Q6W8Q3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pcp4l1Q6W8Q3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pcp4l1Q6W8Q3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pcp4l1Q6W8Q3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pcp4l1Q6W8Q3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pcp4l1Q6W8Q3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pcp4l1Q6W8Q3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pcp4l1Q6W8Q3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms