Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIX5

Rhbdf1, Inactive rhomboid protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdf1Q6PIX5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rhbdf1Q6PIX5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rhbdf1Q6PIX5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rhbdf1Q6PIX5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rhbdf1Q6PIX5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rhbdf1Q6PIX5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rhbdf1Q6PIX5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rhbdf1Q6PIX5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rhbdf1Q6PIX5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rhbdf1Q6PIX5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rhbdf1Q6PIX5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rhbdf1Q6PIX5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rhbdf1Q6PIX5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rhbdf1Q6PIX5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rhbdf1Q6PIX5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rhbdf1Q6PIX5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rhbdf1Q6PIX5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rhbdf1Q6PIX5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rhbdf1Q6PIX5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rhbdf1Q6PIX5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rhbdf1Q6PIX5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rhbdf1Q6PIX5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rhbdf1Q6PIX5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rhbdf1Q6PIX5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rhbdf1Q6PIX5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rhbdf1Q6PIX5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rhbdf1Q6PIX5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rhbdf1Q6PIX5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rhbdf1Q6PIX5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rhbdf1Q6PIX5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rhbdf1Q6PIX5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rhbdf1Q6PIX5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rhbdf1Q6PIX5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rhbdf1Q6PIX5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rhbdf1Q6PIX5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rhbdf1Q6PIX5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rhbdf1Q6PIX5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rhbdf1Q6PIX5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rhbdf1Q6PIX5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rhbdf1Q6PIX5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rhbdf1Q6PIX5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rhbdf1Q6PIX5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rhbdf1Q6PIX5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rhbdf1Q6PIX5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rhbdf1Q6PIX5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rhbdf1Q6PIX5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rhbdf1Q6PIX5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rhbdf1Q6PIX5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rhbdf1Q6PIX5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rhbdf1Q6PIX5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rhbdf1Q6PIX5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rhbdf1Q6PIX5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rhbdf1Q6PIX5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rhbdf1Q6PIX5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rhbdf1Q6PIX5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rhbdf1Q6PIX5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rhbdf1Q6PIX5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rhbdf1Q6PIX5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rhbdf1Q6PIX5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rhbdf1Q6PIX5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rhbdf1Q6PIX5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rhbdf1Q6PIX5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rhbdf1Q6PIX5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rhbdf1Q6PIX5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rhbdf1Q6PIX5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rhbdf1Q6PIX5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rhbdf1Q6PIX5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rhbdf1Q6PIX5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rhbdf1Q6PIX5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rhbdf1Q6PIX5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rhbdf1Q6PIX5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rhbdf1Q6PIX5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rhbdf1Q6PIX5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rhbdf1Q6PIX5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rhbdf1Q6PIX5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rhbdf1Q6PIX5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rhbdf1Q6PIX5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rhbdf1Q6PIX5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rhbdf1Q6PIX5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rhbdf1Q6PIX5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rhbdf1Q6PIX5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rhbdf1Q6PIX5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rhbdf1Q6PIX5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rhbdf1Q6PIX5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rhbdf1Q6PIX5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rhbdf1Q6PIX5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rhbdf1Q6PIX5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rhbdf1Q6PIX5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rhbdf1Q6PIX5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rhbdf1Q6PIX5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rhbdf1Q6PIX5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rhbdf1Q6PIX5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rhbdf1Q6PIX5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rhbdf1Q6PIX5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rhbdf1Q6PIX5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rhbdf1Q6PIX5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rhbdf1Q6PIX5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rhbdf1Q6PIX5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rhbdf1Q6PIX5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rhbdf1Q6PIX5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms