Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS9

Cacna2d2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d2Q6PHS9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cacna2d2Q6PHS9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cacna2d2Q6PHS9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cacna2d2Q6PHS9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cacna2d2Q6PHS9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cacna2d2Q6PHS9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cacna2d2Q6PHS9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cacna2d2Q6PHS9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cacna2d2Q6PHS9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cacna2d2Q6PHS9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cacna2d2Q6PHS9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cacna2d2Q6PHS9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cacna2d2Q6PHS9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cacna2d2Q6PHS9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cacna2d2Q6PHS9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cacna2d2Q6PHS9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cacna2d2Q6PHS9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cacna2d2Q6PHS9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cacna2d2Q6PHS9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cacna2d2Q6PHS9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cacna2d2Q6PHS9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cacna2d2Q6PHS9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cacna2d2Q6PHS9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cacna2d2Q6PHS9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cacna2d2Q6PHS9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cacna2d2Q6PHS9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cacna2d2Q6PHS9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cacna2d2Q6PHS9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cacna2d2Q6PHS9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cacna2d2Q6PHS9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cacna2d2Q6PHS9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cacna2d2Q6PHS9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cacna2d2Q6PHS9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cacna2d2Q6PHS9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cacna2d2Q6PHS9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacna2d2Q6PHS9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacna2d2Q6PHS9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacna2d2Q6PHS9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacna2d2Q6PHS9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacna2d2Q6PHS9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cacna2d2Q6PHS9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cacna2d2Q6PHS9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cacna2d2Q6PHS9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cacna2d2Q6PHS9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cacna2d2Q6PHS9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cacna2d2Q6PHS9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cacna2d2Q6PHS9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cacna2d2Q6PHS9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cacna2d2Q6PHS9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cacna2d2Q6PHS9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cacna2d2Q6PHS9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cacna2d2Q6PHS9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cacna2d2Q6PHS9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cacna2d2Q6PHS9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cacna2d2Q6PHS9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cacna2d2Q6PHS9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cacna2d2Q6PHS9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cacna2d2Q6PHS9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cacna2d2Q6PHS9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cacna2d2Q6PHS9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Cacna2d2Q6PHS9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cacna2d2Q6PHS9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cacna2d2Q6PHS9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cacna2d2Q6PHS9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cacna2d2Q6PHS9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cacna2d2Q6PHS9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cacna2d2Q6PHS9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cacna2d2Q6PHS9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cacna2d2Q6PHS9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cacna2d2Q6PHS9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cacna2d2Q6PHS9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cacna2d2Q6PHS9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cacna2d2Q6PHS9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cacna2d2Q6PHS9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cacna2d2Q6PHS9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cacna2d2Q6PHS9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cacna2d2Q6PHS9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cacna2d2Q6PHS9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cacna2d2Q6PHS9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cacna2d2Q6PHS9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cacna2d2Q6PHS9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cacna2d2Q6PHS9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cacna2d2Q6PHS9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cacna2d2Q6PHS9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cacna2d2Q6PHS9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cacna2d2Q6PHS9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cacna2d2Q6PHS9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cacna2d2Q6PHS9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cacna2d2Q6PHS9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cacna2d2Q6PHS9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cacna2d2Q6PHS9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cacna2d2Q6PHS9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cacna2d2Q6PHS9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cacna2d2Q6PHS9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cacna2d2Q6PHS9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cacna2d2Q6PHS9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cacna2d2Q6PHS9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cacna2d2Q6PHS9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cacna2d2Q6PHS9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cacna2d2Q6PHS9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms