Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN9

Rab35, Ras-related protein Rab-35, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab35Q6PHN9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab35Q6PHN9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab35Q6PHN9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab35Q6PHN9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab35Q6PHN9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab35Q6PHN9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab35Q6PHN9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab35Q6PHN9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab35Q6PHN9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab35Q6PHN9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab35Q6PHN9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab35Q6PHN9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab35Q6PHN9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab35Q6PHN9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab35Q6PHN9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab35Q6PHN9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab35Q6PHN9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab35Q6PHN9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab35Q6PHN9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab35Q6PHN9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab35Q6PHN9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab35Q6PHN9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab35Q6PHN9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab35Q6PHN9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab35Q6PHN9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab35Q6PHN9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab35Q6PHN9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab35Q6PHN9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab35Q6PHN9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab35Q6PHN9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab35Q6PHN9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab35Q6PHN9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab35Q6PHN9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab35Q6PHN9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab35Q6PHN9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab35Q6PHN9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab35Q6PHN9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab35Q6PHN9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab35Q6PHN9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab35Q6PHN9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab35Q6PHN9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab35Q6PHN9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab35Q6PHN9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab35Q6PHN9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab35Q6PHN9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab35Q6PHN9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab35Q6PHN9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab35Q6PHN9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab35Q6PHN9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab35Q6PHN9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rab35Q6PHN9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rab35Q6PHN9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rab35Q6PHN9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rab35Q6PHN9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab35Q6PHN9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab35Q6PHN9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab35Q6PHN9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab35Q6PHN9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab35Q6PHN9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab35Q6PHN9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab35Q6PHN9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab35Q6PHN9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab35Q6PHN9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab35Q6PHN9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab35Q6PHN9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab35Q6PHN9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab35Q6PHN9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab35Q6PHN9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rab35Q6PHN9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rab35Q6PHN9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab35Q6PHN9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Rab35Q6PHN9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Rab35Q6PHN9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab35Q6PHN9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab35Q6PHN9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab35Q6PHN9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rab35Q6PHN9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab35Q6PHN9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab35Q6PHN9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab35Q6PHN9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab35Q6PHN9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab35Q6PHN9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab35Q6PHN9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab35Q6PHN9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab35Q6PHN9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab35Q6PHN9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab35Q6PHN9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab35Q6PHN9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab35Q6PHN9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab35Q6PHN9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab35Q6PHN9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab35Q6PHN9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab35Q6PHN9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab35Q6PHN9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab35Q6PHN9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab35Q6PHN9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab35Q6PHN9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab35Q6PHN9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab35Q6PHN9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab35Q6PHN9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms