Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFD7

Naif1, Nuclear apoptosis-inducing factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Naif1Q6PFD7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Naif1Q6PFD7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Naif1Q6PFD7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Naif1Q6PFD7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Naif1Q6PFD7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Naif1Q6PFD7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Naif1Q6PFD7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Naif1Q6PFD7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Naif1Q6PFD7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Naif1Q6PFD7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Naif1Q6PFD7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Naif1Q6PFD7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Naif1Q6PFD7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Naif1Q6PFD7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Naif1Q6PFD7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Naif1Q6PFD7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Naif1Q6PFD7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Naif1Q6PFD7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Naif1Q6PFD7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Naif1Q6PFD7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Naif1Q6PFD7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Naif1Q6PFD7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Naif1Q6PFD7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Naif1Q6PFD7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Naif1Q6PFD7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Naif1Q6PFD7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Naif1Q6PFD7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Naif1Q6PFD7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Naif1Q6PFD7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Naif1Q6PFD7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Naif1Q6PFD7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Naif1Q6PFD7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Naif1Q6PFD7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Naif1Q6PFD7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Naif1Q6PFD7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Naif1Q6PFD7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Naif1Q6PFD7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Naif1Q6PFD7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Naif1Q6PFD7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Naif1Q6PFD7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Naif1Q6PFD7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Naif1Q6PFD7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Naif1Q6PFD7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Naif1Q6PFD7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Naif1Q6PFD7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Naif1Q6PFD7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Naif1Q6PFD7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Naif1Q6PFD7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Naif1Q6PFD7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Naif1Q6PFD7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Naif1Q6PFD7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Naif1Q6PFD7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Naif1Q6PFD7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Naif1Q6PFD7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Naif1Q6PFD7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Naif1Q6PFD7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Naif1Q6PFD7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Naif1Q6PFD7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Naif1Q6PFD7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Naif1Q6PFD7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Naif1Q6PFD7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Naif1Q6PFD7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Naif1Q6PFD7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Naif1Q6PFD7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Naif1Q6PFD7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Naif1Q6PFD7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Naif1Q6PFD7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Naif1Q6PFD7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Naif1Q6PFD7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Naif1Q6PFD7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Naif1Q6PFD7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Naif1Q6PFD7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Naif1Q6PFD7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Naif1Q6PFD7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Naif1Q6PFD7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Naif1Q6PFD7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Naif1Q6PFD7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Naif1Q6PFD7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Naif1Q6PFD7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Naif1Q6PFD7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Naif1Q6PFD7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Naif1Q6PFD7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Naif1Q6PFD7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Naif1Q6PFD7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Naif1Q6PFD7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Naif1Q6PFD7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Naif1Q6PFD7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Naif1Q6PFD7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Naif1Q6PFD7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Naif1Q6PFD7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Naif1Q6PFD7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Naif1Q6PFD7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Naif1Q6PFD7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Naif1Q6PFD7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Naif1Q6PFD7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Naif1Q6PFD7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Naif1Q6PFD7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Naif1Q6PFD7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Naif1Q6PFD7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Naif1Q6PFD7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms