Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM6

Gramd2b, GRAM domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gramd2bQ6PEM6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gramd2bQ6PEM6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gramd2bQ6PEM6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gramd2bQ6PEM6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gramd2bQ6PEM6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gramd2bQ6PEM6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gramd2bQ6PEM6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gramd2bQ6PEM6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gramd2bQ6PEM6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gramd2bQ6PEM6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gramd2bQ6PEM6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gramd2bQ6PEM6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gramd2bQ6PEM6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gramd2bQ6PEM6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gramd2bQ6PEM6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gramd2bQ6PEM6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gramd2bQ6PEM6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gramd2bQ6PEM6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gramd2bQ6PEM6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gramd2bQ6PEM6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gramd2bQ6PEM6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gramd2bQ6PEM6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gramd2bQ6PEM6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gramd2bQ6PEM6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gramd2bQ6PEM6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gramd2bQ6PEM6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gramd2bQ6PEM6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gramd2bQ6PEM6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gramd2bQ6PEM6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gramd2bQ6PEM6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gramd2bQ6PEM6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gramd2bQ6PEM6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gramd2bQ6PEM6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gramd2bQ6PEM6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gramd2bQ6PEM6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gramd2bQ6PEM6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gramd2bQ6PEM6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gramd2bQ6PEM6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gramd2bQ6PEM6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gramd2bQ6PEM6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gramd2bQ6PEM6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gramd2bQ6PEM6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gramd2bQ6PEM6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gramd2bQ6PEM6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gramd2bQ6PEM6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gramd2bQ6PEM6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gramd2bQ6PEM6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gramd2bQ6PEM6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gramd2bQ6PEM6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gramd2bQ6PEM6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gramd2bQ6PEM6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gramd2bQ6PEM6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gramd2bQ6PEM6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gramd2bQ6PEM6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gramd2bQ6PEM6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gramd2bQ6PEM6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gramd2bQ6PEM6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gramd2bQ6PEM6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gramd2bQ6PEM6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gramd2bQ6PEM6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gramd2bQ6PEM6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gramd2bQ6PEM6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gramd2bQ6PEM6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gramd2bQ6PEM6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gramd2bQ6PEM6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gramd2bQ6PEM6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gramd2bQ6PEM6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gramd2bQ6PEM6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gramd2bQ6PEM6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gramd2bQ6PEM6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gramd2bQ6PEM6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gramd2bQ6PEM6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gramd2bQ6PEM6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gramd2bQ6PEM6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gramd2bQ6PEM6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gramd2bQ6PEM6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gramd2bQ6PEM6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gramd2bQ6PEM6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gramd2bQ6PEM6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gramd2bQ6PEM6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gramd2bQ6PEM6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gramd2bQ6PEM6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gramd2bQ6PEM6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gramd2bQ6PEM6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gramd2bQ6PEM6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gramd2bQ6PEM6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gramd2bQ6PEM6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gramd2bQ6PEM6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gramd2bQ6PEM6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gramd2bQ6PEM6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gramd2bQ6PEM6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gramd2bQ6PEM6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gramd2bQ6PEM6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gramd2bQ6PEM6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gramd2bQ6PEM6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gramd2bQ6PEM6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gramd2bQ6PEM6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gramd2bQ6PEM6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gramd2bQ6PEM6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gramd2bQ6PEM6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms