Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vstm2lQ6PDS0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vstm2lQ6PDS0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vstm2lQ6PDS0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vstm2lQ6PDS0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vstm2lQ6PDS0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vstm2lQ6PDS0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vstm2lQ6PDS0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vstm2lQ6PDS0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vstm2lQ6PDS0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vstm2lQ6PDS0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vstm2lQ6PDS0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vstm2lQ6PDS0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vstm2lQ6PDS0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vstm2lQ6PDS0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vstm2lQ6PDS0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vstm2lQ6PDS0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vstm2lQ6PDS0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vstm2lQ6PDS0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vstm2lQ6PDS0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vstm2lQ6PDS0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vstm2lQ6PDS0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vstm2lQ6PDS0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vstm2lQ6PDS0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vstm2lQ6PDS0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vstm2lQ6PDS0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vstm2lQ6PDS0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vstm2lQ6PDS0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vstm2lQ6PDS0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vstm2lQ6PDS0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vstm2lQ6PDS0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vstm2lQ6PDS0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vstm2lQ6PDS0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vstm2lQ6PDS0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vstm2lQ6PDS0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vstm2lQ6PDS0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vstm2lQ6PDS0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vstm2lQ6PDS0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vstm2lQ6PDS0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vstm2lQ6PDS0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vstm2lQ6PDS0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vstm2lQ6PDS0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vstm2lQ6PDS0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vstm2lQ6PDS0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vstm2lQ6PDS0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vstm2lQ6PDS0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vstm2lQ6PDS0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Vstm2lQ6PDS0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vstm2lQ6PDS0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vstm2lQ6PDS0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Vstm2lQ6PDS0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vstm2lQ6PDS0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vstm2lQ6PDS0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vstm2lQ6PDS0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vstm2lQ6PDS0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vstm2lQ6PDS0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vstm2lQ6PDS0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vstm2lQ6PDS0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vstm2lQ6PDS0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vstm2lQ6PDS0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vstm2lQ6PDS0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vstm2lQ6PDS0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vstm2lQ6PDS0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vstm2lQ6PDS0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vstm2lQ6PDS0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vstm2lQ6PDS0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vstm2lQ6PDS0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vstm2lQ6PDS0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vstm2lQ6PDS0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vstm2lQ6PDS0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vstm2lQ6PDS0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vstm2lQ6PDS0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vstm2lQ6PDS0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vstm2lQ6PDS0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vstm2lQ6PDS0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vstm2lQ6PDS0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vstm2lQ6PDS0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vstm2lQ6PDS0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vstm2lQ6PDS0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vstm2lQ6PDS0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vstm2lQ6PDS0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vstm2lQ6PDS0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vstm2lQ6PDS0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vstm2lQ6PDS0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vstm2lQ6PDS0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vstm2lQ6PDS0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vstm2lQ6PDS0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vstm2lQ6PDS0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vstm2lQ6PDS0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vstm2lQ6PDS0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vstm2lQ6PDS0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vstm2lQ6PDS0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vstm2lQ6PDS0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vstm2lQ6PDS0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vstm2lQ6PDS0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vstm2lQ6PDS0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vstm2lQ6PDS0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vstm2lQ6PDS0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vstm2lQ6PDS0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vstm2lQ6PDS0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.7 ms