Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3B9

Rbfa, Putative ribosome-binding factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RbfaQ6P3B9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RbfaQ6P3B9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RbfaQ6P3B9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RbfaQ6P3B9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RbfaQ6P3B9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RbfaQ6P3B9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RbfaQ6P3B9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RbfaQ6P3B9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RbfaQ6P3B9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RbfaQ6P3B9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RbfaQ6P3B9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RbfaQ6P3B9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RbfaQ6P3B9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RbfaQ6P3B9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RbfaQ6P3B9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RbfaQ6P3B9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RbfaQ6P3B9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RbfaQ6P3B9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RbfaQ6P3B9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RbfaQ6P3B9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RbfaQ6P3B9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RbfaQ6P3B9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RbfaQ6P3B9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RbfaQ6P3B9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RbfaQ6P3B9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RbfaQ6P3B9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RbfaQ6P3B9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RbfaQ6P3B9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RbfaQ6P3B9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RbfaQ6P3B9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RbfaQ6P3B9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RbfaQ6P3B9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RbfaQ6P3B9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RbfaQ6P3B9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RbfaQ6P3B9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RbfaQ6P3B9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RbfaQ6P3B9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RbfaQ6P3B9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RbfaQ6P3B9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RbfaQ6P3B9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RbfaQ6P3B9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RbfaQ6P3B9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RbfaQ6P3B9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RbfaQ6P3B9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RbfaQ6P3B9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RbfaQ6P3B9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RbfaQ6P3B9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RbfaQ6P3B9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RbfaQ6P3B9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RbfaQ6P3B9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RbfaQ6P3B9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RbfaQ6P3B9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RbfaQ6P3B9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RbfaQ6P3B9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RbfaQ6P3B9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RbfaQ6P3B9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RbfaQ6P3B9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RbfaQ6P3B9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RbfaQ6P3B9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RbfaQ6P3B9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RbfaQ6P3B9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RbfaQ6P3B9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RbfaQ6P3B9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RbfaQ6P3B9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RbfaQ6P3B9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RbfaQ6P3B9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RbfaQ6P3B9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RbfaQ6P3B9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RbfaQ6P3B9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RbfaQ6P3B9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RbfaQ6P3B9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RbfaQ6P3B9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RbfaQ6P3B9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RbfaQ6P3B9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RbfaQ6P3B9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RbfaQ6P3B9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RbfaQ6P3B9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RbfaQ6P3B9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RbfaQ6P3B9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RbfaQ6P3B9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RbfaQ6P3B9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RbfaQ6P3B9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RbfaQ6P3B9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RbfaQ6P3B9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RbfaQ6P3B9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RbfaQ6P3B9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RbfaQ6P3B9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RbfaQ6P3B9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RbfaQ6P3B9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RbfaQ6P3B9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RbfaQ6P3B9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RbfaQ6P3B9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RbfaQ6P3B9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RbfaQ6P3B9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RbfaQ6P3B9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RbfaQ6P3B9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RbfaQ6P3B9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RbfaQ6P3B9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RbfaQ6P3B9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RbfaQ6P3B9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.8 ms