Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZK8

Ptpdc1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpdc1Q6NZK8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ptpdc1Q6NZK8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ptpdc1Q6NZK8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ptpdc1Q6NZK8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ptpdc1Q6NZK8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ptpdc1Q6NZK8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ptpdc1Q6NZK8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ptpdc1Q6NZK8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ptpdc1Q6NZK8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ptpdc1Q6NZK8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ptpdc1Q6NZK8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ptpdc1Q6NZK8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ptpdc1Q6NZK8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ptpdc1Q6NZK8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ptpdc1Q6NZK8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ptpdc1Q6NZK8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ptpdc1Q6NZK8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ptpdc1Q6NZK8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ptpdc1Q6NZK8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ptpdc1Q6NZK8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ptpdc1Q6NZK8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ptpdc1Q6NZK8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ptpdc1Q6NZK8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ptpdc1Q6NZK8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ptpdc1Q6NZK8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ptpdc1Q6NZK8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ptpdc1Q6NZK8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ptpdc1Q6NZK8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ptpdc1Q6NZK8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ptpdc1Q6NZK8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ptpdc1Q6NZK8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ptpdc1Q6NZK8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ptpdc1Q6NZK8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ptpdc1Q6NZK8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ptpdc1Q6NZK8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Ptpdc1Q6NZK8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Ptpdc1Q6NZK8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ptpdc1Q6NZK8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ptpdc1Q6NZK8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ptpdc1Q6NZK8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ptpdc1Q6NZK8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ptpdc1Q6NZK8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ptpdc1Q6NZK8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ptpdc1Q6NZK8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ptpdc1Q6NZK8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ptpdc1Q6NZK8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ptpdc1Q6NZK8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ptpdc1Q6NZK8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ptpdc1Q6NZK8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ptpdc1Q6NZK8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ptpdc1Q6NZK8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ptpdc1Q6NZK8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ptpdc1Q6NZK8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ptpdc1Q6NZK8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ptpdc1Q6NZK8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ptpdc1Q6NZK8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ptpdc1Q6NZK8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ptpdc1Q6NZK8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ptpdc1Q6NZK8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ptpdc1Q6NZK8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ptpdc1Q6NZK8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ptpdc1Q6NZK8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ptpdc1Q6NZK8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ptpdc1Q6NZK8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ptpdc1Q6NZK8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ptpdc1Q6NZK8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ptpdc1Q6NZK8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ptpdc1Q6NZK8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ptpdc1Q6NZK8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ptpdc1Q6NZK8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ptpdc1Q6NZK8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ptpdc1Q6NZK8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ptpdc1Q6NZK8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ptpdc1Q6NZK8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ptpdc1Q6NZK8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ptpdc1Q6NZK8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ptpdc1Q6NZK8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ptpdc1Q6NZK8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ptpdc1Q6NZK8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ptpdc1Q6NZK8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ptpdc1Q6NZK8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ptpdc1Q6NZK8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ptpdc1Q6NZK8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ptpdc1Q6NZK8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ptpdc1Q6NZK8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ptpdc1Q6NZK8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ptpdc1Q6NZK8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ptpdc1Q6NZK8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ptpdc1Q6NZK8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ptpdc1Q6NZK8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ptpdc1Q6NZK8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ptpdc1Q6NZK8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ptpdc1Q6NZK8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ptpdc1Q6NZK8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ptpdc1Q6NZK8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ptpdc1Q6NZK8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ptpdc1Q6NZK8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ptpdc1Q6NZK8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ptpdc1Q6NZK8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms