Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZC7

Sec23ip, SEC23-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23ipQ6NZC7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Sec23ipQ6NZC7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sec23ipQ6NZC7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sec23ipQ6NZC7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sec23ipQ6NZC7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sec23ipQ6NZC7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sec23ipQ6NZC7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sec23ipQ6NZC7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sec23ipQ6NZC7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sec23ipQ6NZC7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sec23ipQ6NZC7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sec23ipQ6NZC7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sec23ipQ6NZC7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sec23ipQ6NZC7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sec23ipQ6NZC7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sec23ipQ6NZC7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Sec23ipQ6NZC7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Sec23ipQ6NZC7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sec23ipQ6NZC7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sec23ipQ6NZC7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sec23ipQ6NZC7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sec23ipQ6NZC7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sec23ipQ6NZC7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sec23ipQ6NZC7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Sec23ipQ6NZC7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sec23ipQ6NZC7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sec23ipQ6NZC7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sec23ipQ6NZC7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sec23ipQ6NZC7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sec23ipQ6NZC7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sec23ipQ6NZC7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sec23ipQ6NZC7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sec23ipQ6NZC7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sec23ipQ6NZC7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sec23ipQ6NZC7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sec23ipQ6NZC7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sec23ipQ6NZC7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sec23ipQ6NZC7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sec23ipQ6NZC7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sec23ipQ6NZC7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sec23ipQ6NZC7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sec23ipQ6NZC7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sec23ipQ6NZC7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Sec23ipQ6NZC7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sec23ipQ6NZC7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sec23ipQ6NZC7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Sec23ipQ6NZC7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sec23ipQ6NZC7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sec23ipQ6NZC7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sec23ipQ6NZC7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sec23ipQ6NZC7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sec23ipQ6NZC7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Sec23ipQ6NZC7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Sec23ipQ6NZC7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sec23ipQ6NZC7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sec23ipQ6NZC7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sec23ipQ6NZC7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sec23ipQ6NZC7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sec23ipQ6NZC7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sec23ipQ6NZC7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sec23ipQ6NZC7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sec23ipQ6NZC7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sec23ipQ6NZC7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sec23ipQ6NZC7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sec23ipQ6NZC7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sec23ipQ6NZC7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sec23ipQ6NZC7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sec23ipQ6NZC7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sec23ipQ6NZC7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sec23ipQ6NZC7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sec23ipQ6NZC7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sec23ipQ6NZC7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sec23ipQ6NZC7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sec23ipQ6NZC7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Sec23ipQ6NZC7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sec23ipQ6NZC7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sec23ipQ6NZC7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sec23ipQ6NZC7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sec23ipQ6NZC7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sec23ipQ6NZC7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sec23ipQ6NZC7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sec23ipQ6NZC7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sec23ipQ6NZC7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sec23ipQ6NZC7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sec23ipQ6NZC7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sec23ipQ6NZC7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sec23ipQ6NZC7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sec23ipQ6NZC7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Sec23ipQ6NZC7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sec23ipQ6NZC7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sec23ipQ6NZC7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sec23ipQ6NZC7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sec23ipQ6NZC7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sec23ipQ6NZC7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sec23ipQ6NZC7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sec23ipQ6NZC7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sec23ipQ6NZC7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Sec23ipQ6NZC7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sec23ipQ6NZC7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sec23ipQ6NZC7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 143.8 ms