Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rprd2Q6NXI6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rprd2Q6NXI6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rprd2Q6NXI6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rprd2Q6NXI6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rprd2Q6NXI6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rprd2Q6NXI6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rprd2Q6NXI6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rprd2Q6NXI6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rprd2Q6NXI6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rprd2Q6NXI6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rprd2Q6NXI6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rprd2Q6NXI6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rprd2Q6NXI6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rprd2Q6NXI6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rprd2Q6NXI6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Rprd2Q6NXI6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Rprd2Q6NXI6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Rprd2Q6NXI6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Rprd2Q6NXI6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Rprd2Q6NXI6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Rprd2Q6NXI6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Rprd2Q6NXI6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Rprd2Q6NXI6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Rprd2Q6NXI6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Rprd2Q6NXI6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Rprd2Q6NXI6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Rprd2Q6NXI6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Rprd2Q6NXI6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Rprd2Q6NXI6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Rprd2Q6NXI6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Rprd2Q6NXI6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rprd2Q6NXI6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rprd2Q6NXI6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Rprd2Q6NXI6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rprd2Q6NXI6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rprd2Q6NXI6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rprd2Q6NXI6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rprd2Q6NXI6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rprd2Q6NXI6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rprd2Q6NXI6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rprd2Q6NXI6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rprd2Q6NXI6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rprd2Q6NXI6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rprd2Q6NXI6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rprd2Q6NXI6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rprd2Q6NXI6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rprd2Q6NXI6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Rprd2Q6NXI6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rprd2Q6NXI6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rprd2Q6NXI6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rprd2Q6NXI6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rprd2Q6NXI6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rprd2Q6NXI6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rprd2Q6NXI6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Rprd2Q6NXI6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rprd2Q6NXI6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rprd2Q6NXI6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rprd2Q6NXI6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rprd2Q6NXI6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rprd2Q6NXI6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rprd2Q6NXI6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rprd2Q6NXI6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rprd2Q6NXI6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rprd2Q6NXI6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Rprd2Q6NXI6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Rprd2Q6NXI6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Rprd2Q6NXI6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rprd2Q6NXI6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rprd2Q6NXI6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rprd2Q6NXI6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rprd2Q6NXI6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rprd2Q6NXI6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rprd2Q6NXI6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rprd2Q6NXI6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rprd2Q6NXI6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rprd2Q6NXI6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rprd2Q6NXI6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Rprd2Q6NXI6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rprd2Q6NXI6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rprd2Q6NXI6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rprd2Q6NXI6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rprd2Q6NXI6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rprd2Q6NXI6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rprd2Q6NXI6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rprd2Q6NXI6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rprd2Q6NXI6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rprd2Q6NXI6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rprd2Q6NXI6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rprd2Q6NXI6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rprd2Q6NXI6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rprd2Q6NXI6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rprd2Q6NXI6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Rprd2Q6NXI6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rprd2Q6NXI6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rprd2Q6NXI6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rprd2Q6NXI6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rprd2Q6NXI6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rprd2Q6NXI6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rprd2Q6NXI6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms