Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HelbQ6NVF4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HelbQ6NVF4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HelbQ6NVF4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HelbQ6NVF4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HelbQ6NVF4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HelbQ6NVF4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HelbQ6NVF4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HelbQ6NVF4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HelbQ6NVF4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HelbQ6NVF4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HelbQ6NVF4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HelbQ6NVF4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HelbQ6NVF4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HelbQ6NVF4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HelbQ6NVF4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HelbQ6NVF4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HelbQ6NVF4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HelbQ6NVF4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HelbQ6NVF4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HelbQ6NVF4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HelbQ6NVF4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HelbQ6NVF4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HelbQ6NVF4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HelbQ6NVF4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HelbQ6NVF4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HelbQ6NVF4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HelbQ6NVF4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HelbQ6NVF4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HelbQ6NVF4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HelbQ6NVF4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HelbQ6NVF4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HelbQ6NVF4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HelbQ6NVF4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HelbQ6NVF4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HelbQ6NVF4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HelbQ6NVF4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HelbQ6NVF4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HelbQ6NVF4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HelbQ6NVF4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HelbQ6NVF4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HelbQ6NVF4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HelbQ6NVF4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HelbQ6NVF4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HelbQ6NVF4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HelbQ6NVF4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HelbQ6NVF4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HelbQ6NVF4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HelbQ6NVF4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HelbQ6NVF4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HelbQ6NVF4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HelbQ6NVF4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HelbQ6NVF4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HelbQ6NVF4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HelbQ6NVF4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HelbQ6NVF4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HelbQ6NVF4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HelbQ6NVF4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HelbQ6NVF4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HelbQ6NVF4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HelbQ6NVF4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HelbQ6NVF4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HelbQ6NVF4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HelbQ6NVF4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HelbQ6NVF4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HelbQ6NVF4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HelbQ6NVF4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HelbQ6NVF4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HelbQ6NVF4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HelbQ6NVF4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HelbQ6NVF4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HelbQ6NVF4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HelbQ6NVF4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HelbQ6NVF4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HelbQ6NVF4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HelbQ6NVF4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HelbQ6NVF4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HelbQ6NVF4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HelbQ6NVF4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HelbQ6NVF4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HelbQ6NVF4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HelbQ6NVF4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HelbQ6NVF4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HelbQ6NVF4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HelbQ6NVF4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HelbQ6NVF4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HelbQ6NVF4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HelbQ6NVF4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HelbQ6NVF4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HelbQ6NVF4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HelbQ6NVF4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HelbQ6NVF4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HelbQ6NVF4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HelbQ6NVF4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HelbQ6NVF4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HelbQ6NVF4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HelbQ6NVF4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HelbQ6NVF4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HelbQ6NVF4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HelbQ6NVF4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms