Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CltbQ6IRU5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CltbQ6IRU5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CltbQ6IRU5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CltbQ6IRU5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CltbQ6IRU5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CltbQ6IRU5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CltbQ6IRU5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CltbQ6IRU5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CltbQ6IRU5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CltbQ6IRU5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CltbQ6IRU5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CltbQ6IRU5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CltbQ6IRU5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CltbQ6IRU5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CltbQ6IRU5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CltbQ6IRU5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CltbQ6IRU5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CltbQ6IRU5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CltbQ6IRU5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CltbQ6IRU5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CltbQ6IRU5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CltbQ6IRU5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CltbQ6IRU5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CltbQ6IRU5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CltbQ6IRU5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CltbQ6IRU5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CltbQ6IRU5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CltbQ6IRU5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CltbQ6IRU5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CltbQ6IRU5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CltbQ6IRU5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CltbQ6IRU5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CltbQ6IRU5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CltbQ6IRU5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CltbQ6IRU5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CltbQ6IRU5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CltbQ6IRU5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CltbQ6IRU5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CltbQ6IRU5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CltbQ6IRU5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CltbQ6IRU5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CltbQ6IRU5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CltbQ6IRU5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CltbQ6IRU5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CltbQ6IRU5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CltbQ6IRU5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CltbQ6IRU5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CltbQ6IRU5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CltbQ6IRU5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CltbQ6IRU5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CltbQ6IRU5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CltbQ6IRU5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CltbQ6IRU5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CltbQ6IRU5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CltbQ6IRU5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CltbQ6IRU5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CltbQ6IRU5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CltbQ6IRU5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CltbQ6IRU5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CltbQ6IRU5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CltbQ6IRU5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CltbQ6IRU5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CltbQ6IRU5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CltbQ6IRU5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CltbQ6IRU5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CltbQ6IRU5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CltbQ6IRU5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CltbQ6IRU5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CltbQ6IRU5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CltbQ6IRU5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CltbQ6IRU5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CltbQ6IRU5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CltbQ6IRU5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CltbQ6IRU5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CltbQ6IRU5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CltbQ6IRU5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CltbQ6IRU5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CltbQ6IRU5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CltbQ6IRU5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CltbQ6IRU5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CltbQ6IRU5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CltbQ6IRU5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CltbQ6IRU5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CltbQ6IRU5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CltbQ6IRU5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CltbQ6IRU5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CltbQ6IRU5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CltbQ6IRU5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CltbQ6IRU5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CltbQ6IRU5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CltbQ6IRU5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CltbQ6IRU5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CltbQ6IRU5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CltbQ6IRU5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CltbQ6IRU5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CltbQ6IRU5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CltbQ6IRU5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CltbQ6IRU5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CltbQ6IRU5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms