Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFZ6

Krt77, Keratin, type II cytoskeletal 1b, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt77Q6IFZ6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Krt77Q6IFZ6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Krt77Q6IFZ6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Krt77Q6IFZ6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Krt77Q6IFZ6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Krt77Q6IFZ6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Krt77Q6IFZ6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Krt77Q6IFZ6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Krt77Q6IFZ6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Krt77Q6IFZ6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Krt77Q6IFZ6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Krt77Q6IFZ6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Krt77Q6IFZ6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Krt77Q6IFZ6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Krt77Q6IFZ6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Krt77Q6IFZ6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Krt77Q6IFZ6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Krt77Q6IFZ6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Krt77Q6IFZ6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Krt77Q6IFZ6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Krt77Q6IFZ6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Krt77Q6IFZ6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Krt77Q6IFZ6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Krt77Q6IFZ6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Krt77Q6IFZ6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Krt77Q6IFZ6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Krt77Q6IFZ6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Krt77Q6IFZ6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Krt77Q6IFZ6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Krt77Q6IFZ6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Krt77Q6IFZ6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Krt77Q6IFZ6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Krt77Q6IFZ6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Krt77Q6IFZ6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Krt77Q6IFZ6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Krt77Q6IFZ6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Krt77Q6IFZ6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Krt77Q6IFZ6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Krt77Q6IFZ6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Krt77Q6IFZ6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Krt77Q6IFZ6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Krt77Q6IFZ6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Krt77Q6IFZ6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Krt77Q6IFZ6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Krt77Q6IFZ6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Krt77Q6IFZ6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Krt77Q6IFZ6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Krt77Q6IFZ6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Krt77Q6IFZ6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Krt77Q6IFZ6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Krt77Q6IFZ6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Krt77Q6IFZ6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Krt77Q6IFZ6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Krt77Q6IFZ6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Krt77Q6IFZ6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Krt77Q6IFZ6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Krt77Q6IFZ6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Krt77Q6IFZ6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Krt77Q6IFZ6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Krt77Q6IFZ6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Krt77Q6IFZ6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Krt77Q6IFZ6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Krt77Q6IFZ6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Krt77Q6IFZ6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Krt77Q6IFZ6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Krt77Q6IFZ6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Krt77Q6IFZ6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Krt77Q6IFZ6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Krt77Q6IFZ6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Krt77Q6IFZ6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Krt77Q6IFZ6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Krt77Q6IFZ6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Krt77Q6IFZ6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Krt77Q6IFZ6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt77Q6IFZ6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt77Q6IFZ6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt77Q6IFZ6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt77Q6IFZ6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt77Q6IFZ6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt77Q6IFZ6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt77Q6IFZ6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt77Q6IFZ6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt77Q6IFZ6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt77Q6IFZ6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt77Q6IFZ6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt77Q6IFZ6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt77Q6IFZ6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt77Q6IFZ6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt77Q6IFZ6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Krt77Q6IFZ6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Krt77Q6IFZ6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Krt77Q6IFZ6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Krt77Q6IFZ6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Krt77Q6IFZ6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Krt77Q6IFZ6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Krt77Q6IFZ6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Krt77Q6IFZ6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Krt77Q6IFZ6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Krt77Q6IFZ6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Krt77Q6IFZ6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms