Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQX2

Nckap5l, Nck-associated protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap5lQ6GQX2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nckap5lQ6GQX2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nckap5lQ6GQX2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Nckap5lQ6GQX2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nckap5lQ6GQX2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nckap5lQ6GQX2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nckap5lQ6GQX2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nckap5lQ6GQX2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nckap5lQ6GQX2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nckap5lQ6GQX2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nckap5lQ6GQX2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nckap5lQ6GQX2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nckap5lQ6GQX2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Nckap5lQ6GQX2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nckap5lQ6GQX2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nckap5lQ6GQX2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nckap5lQ6GQX2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nckap5lQ6GQX2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nckap5lQ6GQX2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nckap5lQ6GQX2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nckap5lQ6GQX2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nckap5lQ6GQX2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nckap5lQ6GQX2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nckap5lQ6GQX2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nckap5lQ6GQX2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nckap5lQ6GQX2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nckap5lQ6GQX2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nckap5lQ6GQX2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nckap5lQ6GQX2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nckap5lQ6GQX2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nckap5lQ6GQX2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nckap5lQ6GQX2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Nckap5lQ6GQX2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nckap5lQ6GQX2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Nckap5lQ6GQX2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nckap5lQ6GQX2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nckap5lQ6GQX2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nckap5lQ6GQX2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nckap5lQ6GQX2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nckap5lQ6GQX2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nckap5lQ6GQX2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Nckap5lQ6GQX2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nckap5lQ6GQX2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nckap5lQ6GQX2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nckap5lQ6GQX2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nckap5lQ6GQX2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nckap5lQ6GQX2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nckap5lQ6GQX2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Nckap5lQ6GQX2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nckap5lQ6GQX2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nckap5lQ6GQX2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nckap5lQ6GQX2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nckap5lQ6GQX2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nckap5lQ6GQX2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nckap5lQ6GQX2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nckap5lQ6GQX2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nckap5lQ6GQX2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Nckap5lQ6GQX2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Nckap5lQ6GQX2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Nckap5lQ6GQX2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nckap5lQ6GQX2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nckap5lQ6GQX2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nckap5lQ6GQX2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Nckap5lQ6GQX2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nckap5lQ6GQX2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nckap5lQ6GQX2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nckap5lQ6GQX2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Nckap5lQ6GQX2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nckap5lQ6GQX2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nckap5lQ6GQX2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nckap5lQ6GQX2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nckap5lQ6GQX2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nckap5lQ6GQX2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nckap5lQ6GQX2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nckap5lQ6GQX2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nckap5lQ6GQX2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nckap5lQ6GQX2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nckap5lQ6GQX2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Nckap5lQ6GQX2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nckap5lQ6GQX2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nckap5lQ6GQX2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nckap5lQ6GQX2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nckap5lQ6GQX2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nckap5lQ6GQX2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nckap5lQ6GQX2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nckap5lQ6GQX2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nckap5lQ6GQX2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nckap5lQ6GQX2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nckap5lQ6GQX2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Nckap5lQ6GQX2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nckap5lQ6GQX2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Nckap5lQ6GQX2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Nckap5lQ6GQX2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Nckap5lQ6GQX2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nckap5lQ6GQX2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nckap5lQ6GQX2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nckap5lQ6GQX2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nckap5lQ6GQX2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nckap5lQ6GQX2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nckap5lQ6GQX2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms