Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Msl2Q69ZF8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Msl2Q69ZF8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Msl2Q69ZF8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Msl2Q69ZF8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Msl2Q69ZF8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Msl2Q69ZF8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Msl2Q69ZF8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Msl2Q69ZF8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Msl2Q69ZF8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Msl2Q69ZF8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Msl2Q69ZF8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Msl2Q69ZF8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Msl2Q69ZF8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Msl2Q69ZF8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Msl2Q69ZF8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Msl2Q69ZF8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msl2Q69ZF8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msl2Q69ZF8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msl2Q69ZF8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msl2Q69ZF8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msl2Q69ZF8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msl2Q69ZF8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msl2Q69ZF8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msl2Q69ZF8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msl2Q69ZF8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msl2Q69ZF8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msl2Q69ZF8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msl2Q69ZF8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msl2Q69ZF8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msl2Q69ZF8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msl2Q69ZF8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msl2Q69ZF8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msl2Q69ZF8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msl2Q69ZF8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msl2Q69ZF8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Msl2Q69ZF8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msl2Q69ZF8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msl2Q69ZF8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msl2Q69ZF8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msl2Q69ZF8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msl2Q69ZF8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msl2Q69ZF8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msl2Q69ZF8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msl2Q69ZF8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Msl2Q69ZF8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msl2Q69ZF8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msl2Q69ZF8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msl2Q69ZF8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msl2Q69ZF8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msl2Q69ZF8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msl2Q69ZF8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msl2Q69ZF8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msl2Q69ZF8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msl2Q69ZF8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msl2Q69ZF8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msl2Q69ZF8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msl2Q69ZF8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msl2Q69ZF8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msl2Q69ZF8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msl2Q69ZF8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msl2Q69ZF8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msl2Q69ZF8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msl2Q69ZF8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msl2Q69ZF8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Msl2Q69ZF8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Msl2Q69ZF8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Msl2Q69ZF8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Msl2Q69ZF8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msl2Q69ZF8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msl2Q69ZF8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msl2Q69ZF8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msl2Q69ZF8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msl2Q69ZF8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Msl2Q69ZF8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msl2Q69ZF8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msl2Q69ZF8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msl2Q69ZF8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msl2Q69ZF8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msl2Q69ZF8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msl2Q69ZF8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msl2Q69ZF8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msl2Q69ZF8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msl2Q69ZF8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Msl2Q69ZF8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msl2Q69ZF8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msl2Q69ZF8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msl2Q69ZF8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msl2Q69ZF8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msl2Q69ZF8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msl2Q69ZF8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msl2Q69ZF8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Msl2Q69ZF8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Msl2Q69ZF8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Msl2Q69ZF8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Msl2Q69ZF8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Msl2Q69ZF8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Msl2Q69ZF8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Msl2Q69ZF8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Msl2Q69ZF8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms