Protein–RNA interactions for Protein: Q66X03

Nlrp9a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9aQ66X03 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nlrp9aQ66X03 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nlrp9aQ66X03 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nlrp9aQ66X03 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nlrp9aQ66X03 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nlrp9aQ66X03 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nlrp9aQ66X03 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nlrp9aQ66X03 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nlrp9aQ66X03 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nlrp9aQ66X03 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nlrp9aQ66X03 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nlrp9aQ66X03 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nlrp9aQ66X03 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nlrp9aQ66X03 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Nlrp9aQ66X03 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nlrp9aQ66X03 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nlrp9aQ66X03 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nlrp9aQ66X03 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nlrp9aQ66X03 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nlrp9aQ66X03 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nlrp9aQ66X03 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nlrp9aQ66X03 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nlrp9aQ66X03 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nlrp9aQ66X03 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nlrp9aQ66X03 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nlrp9aQ66X03 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nlrp9aQ66X03 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nlrp9aQ66X03 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nlrp9aQ66X03 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nlrp9aQ66X03 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nlrp9aQ66X03 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nlrp9aQ66X03 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nlrp9aQ66X03 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nlrp9aQ66X03 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nlrp9aQ66X03 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nlrp9aQ66X03 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nlrp9aQ66X03 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nlrp9aQ66X03 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Nlrp9aQ66X03 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nlrp9aQ66X03 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nlrp9aQ66X03 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Nlrp9aQ66X03 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nlrp9aQ66X03 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nlrp9aQ66X03 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Nlrp9aQ66X03 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nlrp9aQ66X03 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Nlrp9aQ66X03 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nlrp9aQ66X03 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nlrp9aQ66X03 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nlrp9aQ66X03 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nlrp9aQ66X03 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nlrp9aQ66X03 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nlrp9aQ66X03 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Nlrp9aQ66X03 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nlrp9aQ66X03 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nlrp9aQ66X03 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nlrp9aQ66X03 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nlrp9aQ66X03 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nlrp9aQ66X03 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nlrp9aQ66X03 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nlrp9aQ66X03 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nlrp9aQ66X03 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nlrp9aQ66X03 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nlrp9aQ66X03 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nlrp9aQ66X03 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nlrp9aQ66X03 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nlrp9aQ66X03 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nlrp9aQ66X03 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nlrp9aQ66X03 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Nlrp9aQ66X03 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nlrp9aQ66X03 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nlrp9aQ66X03 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nlrp9aQ66X03 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nlrp9aQ66X03 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nlrp9aQ66X03 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nlrp9aQ66X03 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nlrp9aQ66X03 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nlrp9aQ66X03 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nlrp9aQ66X03 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nlrp9aQ66X03 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nlrp9aQ66X03 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nlrp9aQ66X03 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nlrp9aQ66X03 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nlrp9aQ66X03 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nlrp9aQ66X03 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nlrp9aQ66X03 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Nlrp9aQ66X03 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nlrp9aQ66X03 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nlrp9aQ66X03 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nlrp9aQ66X03 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nlrp9aQ66X03 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nlrp9aQ66X03 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nlrp9aQ66X03 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nlrp9aQ66X03 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nlrp9aQ66X03 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nlrp9aQ66X03 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nlrp9aQ66X03 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nlrp9aQ66X03 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nlrp9aQ66X03 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nlrp9aQ66X03 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms