Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gja3Q64448 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gja3Q64448 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gja3Q64448 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gja3Q64448 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gja3Q64448 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gja3Q64448 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gja3Q64448 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gja3Q64448 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gja3Q64448 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gja3Q64448 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gja3Q64448 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gja3Q64448 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gja3Q64448 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gja3Q64448 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gja3Q64448 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gja3Q64448 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gja3Q64448 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gja3Q64448 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gja3Q64448 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gja3Q64448 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gja3Q64448 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gja3Q64448 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gja3Q64448 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gja3Q64448 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gja3Q64448 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gja3Q64448 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gja3Q64448 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gja3Q64448 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gja3Q64448 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gja3Q64448 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gja3Q64448 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Gja3Q64448 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gja3Q64448 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gja3Q64448 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gja3Q64448 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gja3Q64448 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gja3Q64448 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Gja3Q64448 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gja3Q64448 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gja3Q64448 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gja3Q64448 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gja3Q64448 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gja3Q64448 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gja3Q64448 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gja3Q64448 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gja3Q64448 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gja3Q64448 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Gja3Q64448 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gja3Q64448 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gja3Q64448 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gja3Q64448 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gja3Q64448 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gja3Q64448 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gja3Q64448 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gja3Q64448 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gja3Q64448 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gja3Q64448 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gja3Q64448 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gja3Q64448 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gja3Q64448 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gja3Q64448 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gja3Q64448 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gja3Q64448 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gja3Q64448 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gja3Q64448 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gja3Q64448 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gja3Q64448 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Gja3Q64448 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Gja3Q64448 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gja3Q64448 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gja3Q64448 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gja3Q64448 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gja3Q64448 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gja3Q64448 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gja3Q64448 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gja3Q64448 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gja3Q64448 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gja3Q64448 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gja3Q64448 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gja3Q64448 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gja3Q64448 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gja3Q64448 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gja3Q64448 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gja3Q64448 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gja3Q64448 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gja3Q64448 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gja3Q64448 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gja3Q64448 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gja3Q64448 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gja3Q64448 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gja3Q64448 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gja3Q64448 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gja3Q64448 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gja3Q64448 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gja3Q64448 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gja3Q64448 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gja3Q64448 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gja3Q64448 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gja3Q64448 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms