Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trim24Q64127 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trim24Q64127 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trim24Q64127 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Trim24Q64127 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trim24Q64127 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trim24Q64127 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trim24Q64127 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trim24Q64127 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trim24Q64127 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trim24Q64127 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trim24Q64127 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trim24Q64127 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trim24Q64127 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trim24Q64127 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trim24Q64127 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trim24Q64127 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trim24Q64127 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Trim24Q64127 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Trim24Q64127 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trim24Q64127 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trim24Q64127 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trim24Q64127 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trim24Q64127 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Trim24Q64127 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trim24Q64127 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trim24Q64127 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trim24Q64127 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trim24Q64127 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trim24Q64127 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim24Q64127 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim24Q64127 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim24Q64127 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim24Q64127 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim24Q64127 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim24Q64127 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim24Q64127 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim24Q64127 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim24Q64127 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim24Q64127 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim24Q64127 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim24Q64127 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim24Q64127 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim24Q64127 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim24Q64127 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim24Q64127 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim24Q64127 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim24Q64127 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim24Q64127 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim24Q64127 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim24Q64127 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim24Q64127 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim24Q64127 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim24Q64127 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim24Q64127 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim24Q64127 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim24Q64127 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim24Q64127 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim24Q64127 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim24Q64127 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim24Q64127 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim24Q64127 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim24Q64127 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim24Q64127 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim24Q64127 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim24Q64127 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim24Q64127 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim24Q64127 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim24Q64127 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim24Q64127 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim24Q64127 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim24Q64127 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim24Q64127 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim24Q64127 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim24Q64127 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim24Q64127 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim24Q64127 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim24Q64127 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim24Q64127 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim24Q64127 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim24Q64127 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim24Q64127 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trim24Q64127 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trim24Q64127 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trim24Q64127 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trim24Q64127 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim24Q64127 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim24Q64127 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim24Q64127 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim24Q64127 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim24Q64127 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim24Q64127 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim24Q64127 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim24Q64127 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim24Q64127 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim24Q64127 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim24Q64127 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim24Q64127 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim24Q64127 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim24Q64127 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
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